皂荚种质资源SRAP遗传多样性分析及指纹图谱的构建

引用本文

张安世, 张素敏, 范定臣, 刘莹. 皂荚种质资源SRAP遗传多样性分析及指纹图谱的构建[J]. 浙江农业学报, 2017,29(9): 1524-1530.
ZHANG Anshi, ZHANG Sumin, FAN Dingchen, LIU Ying. Genetic diversity and fingerprints of Gleditsia sinensis germplasm based on SRAP [J]. ACTA AGRICULTURAE ZHEJIANGENSIS, 2017,29(9): 1524-1530. 复制到剪切板

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皂荚种质资源SRAP遗传多样性分析及指纹图谱的构建

张安世¹, 张素敏², 范定臣³, 刘莹¹

1.焦作师范高等专科学校理工学院,河南焦作 454000

2.焦作市园林养护所,河南焦作 454000

3.河南省林业科学研究院,河南郑州 450008

作者简介:张安世(1965—),男,河南博爱人,硕士,教授,主要从事植物分子生物学研究。E-mail:aszhang1212@163.com

收稿日期: 2017-03-27

基金资助: 河南省科技攻关项目(14210221100850); 2015年河南省林业厅科技兴林项目

摘要

利用SRAP标记技术对18份皂荚种质材料进行了遗传多样性分析。结果表明,从64对SRAP引物中筛选了17对引物进行PCR扩增,共扩增出222个条带,其中多态性条带213个,多态性比率为95.95%。各引物多态性信息含量( PIC)、观测等位基因数( Na)、有效等位基因数( Ne)、Nei's基因多样性指数( H)和Shannon's信息指数( I)的平均值分别为0.861 1、1.962 3、1.415 3、0.257 2和0.406 6,18份皂荚种质资源间遗传相似系数( GS)为0.522 5~0.955 0。UPGMA聚类分析表明,在遗传相似系数为0.66处可将18份皂荚种质资源分为3组,其中,野皂荚单独为1组,山皂荚和皂荚-T聚为1组,其他皂荚材料聚为1组。利用4对引物扩增的9个多态性位点构建了18份皂荚种质资源的DNA指纹图谱,可以将其区分并精准鉴定。该研究结果将为皂荚种质的鉴定、保存和新品种选育提供一定的理论依据。

关键词: 皂荚; SRAP; DNA指纹图谱; 遗传多样性

中图分类号:S718.46 文献标志码:A 文章编号:1004-1524(2017)09-1524-07 doi: 10.3969/j.issn.1004-1524.2017.09.14

Genetic diversity and fingerprints of Gleditsia sinensis germplasm based on SRAP

ZHANG Anshi¹, ZHANG Sumin², FAN Dingchen³, LIU Ying¹

1. School of Science, Jiaozuo Teachers College, Jiaozuo 454000, China

2. Garden Conserving Institue of Jiaozuo, Jiaozuo 454000, China

3. Henan Academy of Forestry, Zhengzhou 450008, China

Abstract

Genetic diversity of 18 Gleditsia sinensis germplasms were analyzed by SRAP markers. The results showed that 17 primers pairs were screened from 64 primer pairs and 222 bands were obtained, including 213 polymorphic bands, with a polymorphism rate of 95.95%. The average polymorphism information content ( PIC), observed number of alleles ( Na), effective number of alleles ( Ne), Nei's gene diversity ( H) and Shannon's information index ( I) were 0.861 1, 1.962 3, 1.415 3,0.257 2 and 0.406 6, and the genetic similarity coefficients ( GS) among the tested samples ranged from 0.522 5 to 0.955 0. UPGMA analysis showed that 18 Gleditsia sinensis could clustered into 3 groups with the GS of 0.66. Gleditsia heterophylla formed the first group, Gleditsia melanacantha and Zaojia-T were classified into the second group, and the others were classified into the third group. A total of 18 Gleditsia sinensis germplasm DNA fingerprints were constructed from 9 polymorphic loci amplified by 4 primer pairs, and these materials could be distinguished and identified accurately. All these results would provide the important theoretical basis for the identification, conservation and breeding of new cultivar for Gleditsia sinensis germplasms.

Keyword: Gleditsia sinensis; SRAP; DNA fingerprint; genetic diversity

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皂荚(Gleditsia sinensis Lam.)属豆科苏木亚科皂荚属(Gleditsia Linn.)植物, 为中国特有种, 广泛分布于我国东北、华北、华东、华南等地, 是经济林、用材林、防护林及园林绿化的理想树种^{[1, 2]}, 兼有多种优良的生态、经济和社会性能。皂荚还是优良的中药材和工业原料^[3], 皂荚、皂刺、皂根、皂叶均可入药, 具有很高的经济价值和药用价值。目前国内外对皂荚的研究主要集中在皂荚果实与皂刺的活性成分^{[4, 5]}、引种栽培^[6]、生态属性^[2]及遗传学^{[7, 8, 9]}等方面, 分子标记技术也已开始在皂荚研究中应用。邢俊连等^[10]利用已公布的皂荚转录组数据设计得到6 494条EST-SSR特异性引物, 并对其中部分引物进行了PCR扩增实验, 结果证实这些引物在其近缘种间具有很高的通用性。李伟等^[11]利用AFLP分子标记技术对10个南方皂荚群体进行了遗传多样性研究, 具体分析了皂荚群体遗传结构形成的原因, 并提出了皂荚的保护策略。

SRAP即相关序列多态性扩增(Sequence-related amplification polymorphism), 是由Li等^[12]开发的一种新型分子标记技术。该技术针对真核基因中外显子、内含子及启动子的序列差异, 巧妙地设计出2套特异性引物, 可有效地对开放阅读框(open reading frames, ORF)进行PCR扩增。由于被扩增区域为真核基因的ORF, 其本身可能是目的基因的一部分或与目的基因紧密连锁, 因而能对性状进行有效跟踪^[13]。SRAP标记在操作上类似于随机扩增多态性DNA标记(random amplified polymorphic DNA, RAPD), 但其稳定性远优于RAPD技术, 同时还克服了SSR技术(simple sequence repeats)标记引物开发的费时费力以及扩增片段长度多态性技术(amplified fragment length polymorphism, AFLP)复杂、成本昂贵等缺点^[14], 它提供的信息比其他标记更接近于形态学性状的差异^[15]。目前, SRAP标记已广泛应用于植物的遗传多样性分析、品种鉴定、遗传图谱绘制等研究中^{[16, 17, 18]}。

本试验所选用的材料除野皂荚、山皂荚和皂荚-T为实生苗外, 其余的15份材料是以单株产量高、单刺(或单果)平均质量高的植株为接穗、野皂荚为砧木嫁接而获得的无性系, 其中部分品种已经通过河南省林木品种审定委员会审定。另外皂荚-T是从土耳其引进种子的3年生实生苗, 曾被当做皂荚品种, 但其所表现出的形态特征与皂荚有较大差异, 而与山皂荚极为相似。因此, 本试验采用SRAP标记对18份皂荚种质资源进行遗传多样性分析, 并构建DNA指纹图谱, 以期为皂荚种质资源的鉴定、优良品种的选育等提供科学依据。

1 材料与方法

1.1 材料

材料包括3个种共18份, 具体见表1。其中野皂荚、山皂荚和皂荚-T为实生苗, 其余均为嫁接苗。所有材料均随机选取3株, 每株采集2片健康、幼嫩叶片带回实验室置于-80 ℃超低温冰箱保存备用。

表1 供试材料 Table 1 Materials used in study

1.2 皂荚基因组DNA的提取

每个皂荚品种选3株, 每株取1片幼嫩叶片等量混合, 采用改良CTAB法^[19]提取皂荚基因组DNA, 并将模板DNA浓度稀释至20 ng· μ L^-1, 保存于-20 ℃备用。

1.3 SRAP-PCR分析

选用8个正向引物(Me1-Me8)和8个反向引物(em1-em8)组成64对SRAP引物组合对供试材料进行扩增。反应体积为10 μ L, 包括DNA 1.2 μ L, 上下游引物各0.6 μ L, 2× Taq MasterMix 5.0 μ L, RNase-Free water 2.6 μ L。SRAP-PCR扩增程序为:94 ℃ 5 min; 94 ℃ 1 min, 35 ℃ 1 min, 72 ℃ 1.5 min, 5个循环; 94 ℃ 1 min, 51 ℃ 1 min, 72 ℃ 1.5 min, 35个循环; 72 ℃ 7 min, 4 ℃保存。扩增产物用1.5%琼脂糖凝胶分离。

1.4 数据统计与分析

根据电泳结果进行条带的统计分析。电泳图上在相同位置上若出现DNA条带记为“ 1” , 无则记为“ 0” , 形成1、0矩阵, 将此矩阵导入POPGENE1.32软件进行多态性百分率(PPL)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性(H)和Shannon's多样性指数(I)等遗传多样性参数分析, 依据黄秀等^[20]方法计算引物多态性信息含量(PIC), 通过NTSYS-pc 2.0软件依据UPGMA法进行聚类分析, 同时, 参照云天海等^[21]方法构建18份皂荚种质材料的DNA指纹图谱。

2 结果与分析

2.1 SRAP引物筛选与多态性分析

用64对SRAP引物对供试的18份皂荚材料进行了PCR扩增, 最终筛选出了条带清晰、多态性高的17对引物, 所用引物序列及多态性统计结果见表2。17对引物共扩增出222个条带, 多态性条带213个, 多态性比率的平均值为95.95%。多态性信息含量(PIC)的变化范围为0.799 6~0.919 8, 平均值为0.861 1, 说明所选引物在18个皂荚品种间具有很高的SRAP多态性, 图1为引物组合Me8-em7的扩增结果。各引物的观测等位基因数(Na)的变化范围为1.900 0~2.000 0, 平均值为1.962 3; 有效等位基因数(Ne)的变化范围为1.276 4~1.578 1, 平均值为1.415 3; Nei's基因多样性指数(H)的变化范围为0.193 4~0.329 7, 平均值为0.257 2; Shannon's信息指数(I)的变化范围为0.325 7~0.493 5, 平均值为0.406 6。上述结果表明, 18个皂荚品种间存在较丰富的遗传多样性。同时, 利用SPSS17.0软件对3个主要遗传多样性参数有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon's 信息指数(I)进行非参数Kruskal Wallis Test独立样本检验, 结果显示18个皂荚品种间遗传多样性水平存在显著性差异(χ ²=44.308, P< 0.001)。

表2 SRAP引物及多态性分析 Table 2 SRAP primers used for this study and their polymorphic

引物组合 Primer combinations	引物序列 Sequence for primers(5'→ 3')	T	N	PPL/%	PIC	Na	Ne	H	I
Me1-em1	TGAGTCCAAACCGGATA GACTGCGTACGAATTAAT	15	15	100.00	0.8833	2.0000	1.4284	0.2716	0.4292
Me3-em3	TGAGTCCAAACCGGAAT GACTGCGTACGAATTGAC	15	14	93.33	0.8988	1.9333	1.3830	0.2391	0.3792
Me3-em5	TGAGTCCAAACCGGAAT GACTGCGTACGAATTAAC	15	14	93.33	0.8549	1.9333	1.2825	0.1934	0.3257
Me4-em1	TGAGTCCAAACCGGACC GACTGCGTACGAATTAAT	10	10	100.00	0.8366	2.0000	1.4850	0.3055	0.4727
Me4-em2	TGAGTCCAAACCGGACC GACTGCGTACGAATTTGC	12	12	100.00	0.8634	2.0000	1.4108	0.2819	0.4505
Me4-em5	TGAGTCCAAACCGGACC GACTGCGTACGAATTAAC	12	12	100.00	0.8702	2.0000	1.5781	0.3297	0.4935
Me5-em3	TGAGTCCAAACCGGAAG GACTGCGTACGAATTGAC	18	17	94.44	0.9087	1.9444	1.4165	0.2606	0.4108
Me5-em7	TGAGTCCAAACCGGAAG GACTGCGTACGAATTATG	9	9	100.00	0.8020	2.0000	1.4306	0.2592	0.4083
Me5-em8	TGAGTCCAAACCGGAAG GACTGCGTACGAATTAGC	10	10	100.00	0.8433	2.0000	1.5547	0.3191	0.4817
Me6-em2	TGAGTCCAAACCGGTAG GACTGCGTACGAATTTGC	12	12	100.00	0.8398	2.0000	1.3745	0.2536	0.4107
Me6-em4	TGAGTCCAAACCGGTAG GACTGCGTACGAATTTGA	11	11	100.00	0.8292	2.0000	1.3642	0.2407	0.3908
Me7-em3	TGAGTCCAAACCGGTTG GACTGCGTACGAATTGAC	17	16	94.12	0.8915	1.9412	1.3174	0.2139	0.3529
Me7-em6	TGAGTCCAAACCGGTTG GACTGCGTACGAATTGCA	13	12	92.31	0.8823	1.9231	1.5675	0.3243	0.4842
Me7-em8	TGAGTCCAAACCGGTTG GACTGCGTACGAATTAGC	12	11	91.67	0.8183	1.9167	1.2764	0.1975	0.3323
Me8-em5	TGAGTCCAAACCGGTGT GACTGCGTACGAATTAAC	13	12	92.31	0.9198	1.9231	1.3710	0.2345	0.3738
Me8-em7	TGAGTCCAAACCGGTGT GACTGCGTACGAATTATG	18	17	94.44	0.8974	1.9444	1.3892	0.2445	0.3880
Me8-em8	TGAGTCCAAACCGGTGT GACTGCGTACGAATTAGC	10	9	90.00	0.7996	1.9000	1.4302	0.2555	0.3956
总计Total		222	213
平均Mean		13.06		95.95	0.8611	1.9623	1.4153	0.2572	0.4066

T, Total number of loci; N, Number of polymorphic loci; PPL, Percentage of polymorphic loci; PIC, Polymorphism information content; Na, Observed number of alleles; Ne, Effective number of alleles; H, Nei's gene diversity; I, Shannon information index.

T, 位点总数; N, 多态性位点数; PPL, 多态性位点百分率; PIC, 多态性信息含量; Na, 观测等位基因数; Ne, 有效等位基因数; H, Nei's基因多样性; I, Shannon信息指数。

表2 SRAP引物及多态性分析 Table 2 SRAP primers used for this study and their polymorphic

	Figure Option View Download New Window
	图1 引物组合Me8-em7的SRAP扩增结果 M, 标准分子量; 1~18材料编号同表1Fig.1 The SRAP amplification of primer combination of Me3-em5 M, DL 2 000 standard marker; No.1-18 were the same as table 1

2.2 遗传相似性和聚类分析

利用NTSYS-pc软件计算皂荚种质材料间的遗传相似系数(GS), 结果表明, 18份皂荚种质材料间的GS为0.522 5~0.955 0, 平均值为0.727 7, 变幅为0.432 5, 说明供试材料间存在较大的遗传差异。其中焦科4和焦科5的GS最大(0.955 0), 亲缘关系最近, 野皂荚和皂荚-H的GS最小(0.522 5), 亲缘关系最远。

利用NTSYS-pc软件对18份皂荚种质材料进行聚类分析。结果(图2)表明, 在GS为0.66处可将18份皂荚种质材料分为3组。第1组为野皂荚; 第2组为山皂荚和皂荚-T; 第3组共有15份皂荚材料:密刺、嵩刺1、硕刺、皂荚-H、焦科1、焦科3、济科、豫皂1、怀皂王2、博科、豫皂2、太行2、焦科2、焦科4和焦科5。该聚类结果与皂荚的传统分类基本一致。

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	图2 十八份皂荚种质资源的聚类图 1~18材料编号同表1Fig.2 Dendrogram for 18 G. sinensis germplasm based on SRAP marker No. 1-18 were the same as table 1

2.3 DNA指纹图谱的构建

通过分析17对引物对18份皂荚种质材料的扩增结果, 选取Me5-em8、Me6-em4、Me8-em7和Me8-em8共4对引物扩增的9个多态性位点构建了18份皂荚种质的DNA指纹图谱(图3)。

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	图3 十八份皂荚种质资源的DNA指纹图谱 1~18材料编号同表1Fig.3 DNA fingerprint of 18 G. sinensis germplasm based on SRAP marker No. 1-18 were the same as table 1

每份材料都有唯一的指纹图谱, 可以将18份皂荚种质材料区分并准确鉴定。

3 讨论

3.1 皂荚种质资源的遗传多样性分析

SRAP作为一种新型目的基因分子标记(Gene targeted markers, GTMs), 可以对性状进行跟踪, 被认为是在分子标记辅助育种中最可能被大规模应用的一种技术^[22]。与传统的种质资源遗传多样性研究方法相比, 分子标记能直接反映基因组DNA的遗传变异信息, 直接体现该物种在特定环境中遗传多样性水平的高低。因此, 利用SRAP标记技术分析皂荚种质资源的遗传多样性, 了解皂荚种质之间的遗传差异, 对于皂荚种质资源的合理利用及新品种选育具有重要意义。在本研究中, 利用SRAP标记就多个遗传多样性参数分析表明:多态性百分率(PPL)高达95.95%, 多态性信息量(PIC)为0.861 1, 处于高水平(高PIC > 0.5; 0.25< 适中PIC< 0.5; 低PIC< 0.25)^[23], 说明本试验筛选的引物具有较高的多态性, 可以有效地用于皂荚的遗传多样性分析。同样, 有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性(H)和Shannon信息指数(I)分别为1.415 3、0.257 2和0.406 6, 也处于较高水平。另外, 18个皂荚品种间的遗传相似系数(GS)介于0.522 5~0.955 0, 变幅达0.432 5, 说明供试品种间存在较丰富的多样性。对有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon's信息指数(I)进行的非参数Kruskal Wallis Test独立样本检验结果表明, 18个皂荚品种间遗传多样性水平存在显著差异, 具有较为丰富的遗传变异。

3.2 皂荚种质资源的聚类分析

本研究涉及野皂荚、山皂荚和皂荚3个种共18份材料。聚类结果表明, 在GS为0.66处可将18份皂荚种质材料分为3组。其中, 野皂荚单独为1组, 山皂荚和皂荚-T聚为1组, 其余15份皂荚种质材料聚为1组。从整体结果来看, 该聚类结果与皂荚的传统分类基本吻合。在上述第3组的15份皂荚种质材料中, 焦科4和焦科5是以皂荚荚果为目的选育的品种, 其余均以皂刺为目的选育的品种。聚类结果显示, 焦科4和焦科5在所有供试材料中亲缘关系最近, 与预期相符。从聚类图中还可以看出, 部分品种具有一定的地理来源一致性特征。如采集于河南博爱的5份材料除太行2号外, 其余4份材料豫皂1、豫皂2、怀皂王2和博科聚在一起; 采集于河南新郑的3份材料除皂荚-H外, 山皂荚和皂荚-T聚在一起; 采集于河南修武的5份材料聚为2个分支, 焦科1和焦科3为1个分支, 焦科2、焦科4和焦科5为另一分支。另外, 从聚类结果还获得了一个非常有价值的信息, 即皂荚-T是从土耳其引进种子的3年生播种苗, 起初曾被作为皂荚品种, 但其3年生播种苗无论从叶的形态、皮孔大小、形状还是嫩枝的颜色都与山皂荚极为相似, 因此认为该种子在引进时可能鉴定有误。本研究结果显示, 山皂荚和皂荚-T聚为1组, 两者具有很近的亲缘关系, 因此, 应将皂荚-T归为山皂荚而非皂荚品种, 同时还要结合其他分子标记技术及生长过程中所表现出的其他形态学特征进行进一步的验证。

3.3 皂荚品种鉴定与DNA指纹图谱构建

应用DNA分子标记可直接反映植物品种间的遗传差异, 具有不受环境因子和时空条件影响、高效、快捷等优点, 逐渐取代了依据形态学特征的鉴别方法, 已成为植物品种鉴定的最有效方法。如唐源江等^[24]利用17对SRAP引物扩增的48条谱带构建了139份国兰样本的DNA分子身份证, 置信概率达99.99%, 具有唯一性, 可实现对供试国兰品种的精准、快速鉴定。刘君等^[25]利用2对SRAP引物构建的指纹图谱, 可以将9个狗牙根品种进行准确鉴别。徐宗大等^[26]从100对引物中筛选出了可准确鉴别46个品种的3对SRAP核心引物Me1-Em8、Me2-Em7和Me8-Em9, 构建了玫瑰品种的指纹图谱, 可对46个玫瑰品种和4份野生种质进行准确鉴定。本研究利用SRAP技术, 选用4对引物扩增的9个多态性位点构建了18份皂荚种质材料的DNA指纹图谱, 为皂荚种质资源间的鉴别提供了重要的科学依据。

The authors have declared that no competing interests exist.

参考文献

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[13]	龙治坚, 范理璋, 徐刚, 等. SCoT分子标记在植物研究中的应用进展[J]. 植物遗传资源学报, 2015, 16(2): 336-343. LONG Z J, FAN L Z, XU G, et al. Application advance of SCoT molecular markers in plants[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2015, 16(2): 336-343. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[14]	李秀, 徐坤, 巩彪. 生姜种质遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析[J]. 中国农业科学, 2014, 47(4): 718-726. LI X, XU K, GONG B. Genetic diversity and phylogenetic relationship of ginger germplasm resources revealed by SRAPs[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2014, 47(4): 718-726. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[15]	齐兰, 王文泉, 张振文, 等. 利用SRAP标记构建18个木薯品种的DNA指纹图谱[J]. 作物学报, 2010, 36(10): 1642-1648. QI L, WANG W Q, ZHANG Z W, et al. DNA fingerprinting analysis of 18 cassava varieties using sequence-related amplified polymorphism markers[J]. Acta Agronomica Sinica, 2010, 36(10): 1642-1648. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[16]	黄伟, 鲁敏, 张起, 等. 利用SRAP标记分析贵州砂梨资源遗传多样性[J]. 西北植物学报, 2016, 36(2): 280-287. HUANG W, LU M, ZHANG Q, et al. Genetic diversity of Pyrus pyrifolia resources in Guizhou Province using SRAP markers[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2016, 36(2): 280-287. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[17]	李志强, 党志国, 赵志常, 等. 芒果杂交F₁代群体的遗传多样性分析及遗传图谱的构建[J]. 分子植物育种, 2016, 14(4): 953-958. LI Z Q, DANG Z G, ZHAO Z C, et al. Genetic diversity analyze of mango's F₁ hybrids and construction of genetic map[J]. Molecular Plant Breeding, 2016, 14(4): 953-958. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[18]	马胜超, 韩睿, 任鹏鸿, 等. 三十份菊芋资源亲缘关系的SRAP分析[J]. 浙江农业学报, 2014, 26(5): 1212-1217. MA S C, HANG R, REN P H, et al. Analysis of genetic relationship of 30 Jerusalem artichoke germplasm resources by SRAP markers[J]. Acta Agriculturae Zhejiangensis, 2014, 26(5): 1212-1217. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[19]	张安世, 邢智峰, 刘永英, 等. 苔藓植物DNA不同提取方法的比较分析[J]. 河南科学, 2009, 27(5): 559-562. ZHANG A S, XING Z F, LIU Y Y, et al. Comparison and analysis on the different methods of DNA extration methods from bryophytes[J]. Henan Science, 2009, 27(5): 559-562. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[20]	黄秀, 曾捷, 聂刚, 等. 牛鞭草品EST-SS指纹图谱构建及遗传多样性分析[J]. 热带亚热带植物学报, 2014, 22(2): 165-171. HUANG X, ZENG J, NIE G, et al. Construction of fingerprinting and genetic diversity analysis of Hemarthia cultivars by EST-SSR[J]. Journal of Tropical & Subtropical Botany, 2014, 22(2): 165-171. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[21]	云天海, 郑道君, 谢良商, 等. 中国南瓜海南农家品种间的遗传特异性分析和DNA指纹图谱构建[J]. 植物遗传资源学报, 2013, 14(4): 679-685. YUN T H, ZHENG D J, XIE L S, et al. Analysis of genetic specificity and DNA fingerprinting establishment for the Hainan Island land races of Cucurbita moschata[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2013, 14(4): 679-685. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[22]	林清, 龙治坚, 韩国辉, 等. 基于SCoT标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱[J]. 中国蔬菜, 2013 (12): 31-39. LIN Q, LONG Z J, HAN G H, et al. Genetic diversity and fingerprint based on SCoT markers in Brassica juncea(L. ) Czern. et Coss. [J]. China Vegetables, 2013 (12): 31-39. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[23]	徐玉仙, 张微微, 莫海波, 等. 基于EST-SSR标记的莲属种质资源遗传多样性分析[J]. 植物分类与资源学报, 2015, 37(5): 595-604. XU Y X, ZHANG W W, MO H B, et al. Genetic diversity analysis of Nelumbo accessions based on EST-SSR markers[J]. Plant Diversity and Resources, 2015, 37(5): 595-604. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[24]	唐源江, 曹雯静, 吴坤林. 基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建[J]. 中国农业科学, 2015, 48(9): 1795-1806. TANG Y J, CAO W J, WU K L. Genetic diversity analysis and molecular identification card construction of Chinese cymbidium germplasms based on SRAP markers[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2015, 48(9): 1795-1806. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[25]	刘君, 赵琴, 杨志民. SRAP分子标记对九个狗牙根品种的鉴定分析[J]. 中国草地学报, 2012, 34(4): 21-25. LIU J, ZHAO Q, YANG Z M. Identification of nine Cynodon dactylon varieties by SRAP molecular markers[J]. Chinese Journal of Grassland , 2012, 34(4): 21-25. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[26]	徐宗大, 赵兰勇, 张玲, 等. 玫瑰SRAP遗传多样性分析与品种指纹图谱构建[J]. 中国农业科学, 2011, 44(8): 1662-1669. XU Z D, ZHAO L Y, ZHANG L, et al. Analysis of genetic diversity and construction of fingerprint of Rosa rugosa by SRAP[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2011, 44(8): 1662-1669. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]

2004

0.0

兰彦平, 周连第, 李淑英, 等. 皂荚( 属) 研究进展及产业化发展前景[J]. 世界林业研究, 2004, 17(6): 17-21.

LAN Y

, ZHOU L

, LI S

, et al. Advances in research of Gleditsia and its prospect of industrializational development[J]. World Forestry Research, 2004, 17(6): 17-21. (in Chinese with English abstract)

综述了国内外皂荚(属)主要研究进展,包括引种栽培、种实、刺特征与成份、抗逆性、药用价值、生态经济价值、食品及其它工业的开发应用、繁殖技术、遗传学研究等方面。从皂荚(属)资源保护、评价与合理利用及产业化发展的角度,提出开展种源试验与选择、繁殖技术研究,建立良种选育机制和种质资源保存机制,完善加工型企业,从而促进社会经济增长等产业化发展对策。

... )植物,为中国特有种,广泛分布于我国东北、华北、华东、华南等地,是经济林、用材林、防护林及园林绿化的理想树种^[1,2],兼有多种优良的生态、经济和社会性能 ...

2003

0.0

杨海东. 皂荚的多种功效及其绿化应用[J]. 贵州农业科学, 2003, 31(4) : 73-74.

YANG H

Multi-function of Gleditsia sinensis and its application in land afforestation[J]. Guizhou Agricultural Sciences, 2003, 31(4) : 73-74. (in Chinese with English abstract)

皂荚,别名皂角(Gleditsia sinensis Lam.),是豆科皂荚属落叶高大乔木,树干挺拔,树姿优美,寿命长达700余年,为优良用材和"四旁"绿化树种[1].皂荚具有很高的药用价值,既是优良的城市抗污染剂和日用化工原料,又是良好的杀虫剂,其木材坚硬,油漆性能良好,耐腐耐磨,是家具、车辆、工艺的好材料,在绿化上具有广阔的栽培利用前景.

... 目前国内外对皂荚的研究主要集中在皂荚果实与皂刺的活性成分^[4,5]、引种栽培^[6]、生态属性^[2]及遗传学^[7,8,9]等方面,分子标记技术也已开始在皂荚研究中应用 ...

2001

0.0

朱莉伟, 蒋建新. 皂荚豆和日本皂荚豆氨基酸及脂肪酸组成分析[J]. 中国野生植物资源, 2001, 20(4): 40-41.

ZHU L

, JIANG J

Analysis of amino acid and fatty acid for bean of Gleditsia and Gleditsia japonica[J]. Chinese Wild Plant Resources, 2001, 20(4): 40-41. (in Chinese with English abstract)

本文首次分析报道了皂荚豆和日本皂荚豆蛋白质含量与氨基酸组成以及脂肪油性质与脂肪酸组成,旨在为种子的综合开发利用提供依据.

... 皂荚还是优良的中药材和工业原料^[3],皂荚、皂刺、皂根、皂叶均可入药,具有很高的经济价值和药用价值 ...

2013

0.0

张宏利, 简利茹, 韩崇选, 等. 皂荚果实中皂苷O的分离鉴定及毒性研究[J]. 西北植物学报, 2013, 33(6): 1234-1238.

ZHANG H

, JIAN L

, HAN C

, et al. Isolation, identification and toxicity of Gleditsiosides O[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2013, 33(6): 1234-1238. (in Chinese with English abstract)

A triterpenoid saponin was isolated from the pod of Gleditsia sinensis Lam.by ethanol extraction and silica gel column chromatography,and was identified by TLC,mp,IR,MS, 1 H-NMR and 13 C-NMR.Its structure was determined to be 3-O- β -D-xylopyranosyl-（1→2)-α-L-arabinopyranosyl-（1→6)- β -D-glucopyranosyl oleanolic acid 28-O- β -D-xylopyranosyl-（1→3)- β -D-xylopyranosyl-（1→4)-α-L-rhamnopyranosyl-（1→2)-[（6S),（2E)-6-hydroxy-2,6-dimethy-2,7-octadienoyl-（1→3)and （6′S),（2′E)-6′-hydroxy-2′,6′-dimethy-2′,7′-octadienoyl-（1→6)]- β -D-glucopyranosyl ester.The acute toxicity experiment indicated that the tolerance dose to mouse was 160～400 mg/kg through mouth,and LD 50 was 249.52 mg/kg,with the 95% confidence limit of 224.81～276.95 mg/kg.Its toxicity to mice is greater than that of gleditsioside A.The research results show that the gleditsioside O is the main active ingredient in rat-killing.

采用乙醇提取、正丁醇萃取、常压硅胶柱反复层析的方法,并结合杀鼠活性追踪,从豆科植物皂荚（ Gleditsia sinensis Lam.)的果实中分离到一个含有7个糖基的三萜皂苷,通过TLC、mp、IR、MS、 1 H-NMR和 13 C-NMR等方法鉴定为3-O- β -D-吡喃木糖基-（1→2)-α-L-吡喃阿拉伯糖基-（1→6)- β -D-吡喃葡萄糖基齐墩果酸28-O- β -D-吡喃木糖基-（1→3)- β -D-吡喃木糖基-（1→4)-α-L-吡喃鼠李糖基-（1→2)-[（6S,2E)-6-羟基-2,6-二甲基-2,7-辛二烯醇-（1→3)-（6′S,2′E)-6′-羟基-2′,6′-二甲基-2′,7′-辛二烯醇-（1→6)] - β -D-吡喃葡萄糖酯[即皂荚皂苷O （Gleditsiosides O)]。对小鼠的急性毒性测定结果表明,试鼠对皂荚皂苷O经口灌胃的耐受量为160～400 mg/kg,半数致死剂量LD 50 =249.52 mg/kg,95%可信区间为224.81～276.95 mg/kg;皂荚皂苷O对小鼠的急性毒性大于皂荚皂苷A。研究结果表明，皂荚皂苷O为皂荚的主要杀鼠活性成分。

2014

0.0

姚众, 韩巨才, 刘慧平, 等. 皂荚内生拮抗细菌的分离筛选及代谢产物分析[J]. 山西农业大学学报(自然科学版), 2014, 34(2): 114-116.

YAO

, HAN J

, LIU H

, et al. Isolation and screening of endogenous antagonistic bacteria and the analysis of metabolite from Gleditsia sinensis Lam[J]. Journal of Shanxi Agricultural University, 2014, 34(2): 114-116. (in Chinese with English abstract)

为明确抗病细菌在皂荚体内的分布及其抑菌活性,采用组织分离法从皂荚树中分离筛选出12株有拮抗效果的内生细菌,并通过过滤灭菌处理和高温灭菌处理2种方法对其代谢产物进行分析,选出Z J4、Z J7两株潜在生防菌,并对其抗菌谱进行了测定.结果显示,Z J4、ZJ7经高温灭菌处理后抑菌活性明显下降,推测其可能代谢产生对热敏感的蛋白酶类,而且对不同病原菌的抑制作用表现出一定的选择性,对链格孢属的番茄早疫病菌和梨黑斑病菌效果较好.

2015

0.0

2013

0.0

李伟, 林富荣, 郑勇奇, 等. 皂荚南方天然群体种实表型多样性[J]. 植物生态学, 2013, 37(1): 61-69.

WEI

, LIN F

, ZHENG Y

, et al. Phenotypic diversity of pods and seeds in natural populations of Gleditsia sinensis in southern China[J]. Chinese Journal of Plant Ecology, 2013, 37(1): 61-69. (in Chinese with English abstract)

2013

0.0

李伟, 林富荣, 郑勇奇, 等. 皂荚天然群体间种实表型特性及种子萌发的差异分析[J]. 植物资源与环境学报, 2013, 22(4): 70-75.

WEI

, LIN F

, ZHENG Y

, et al. Variation analysis on phenotypic characteristics of pods and seeds, and seed germination among natural populations of Gleditsia sinensis[J]. Journal of Plant Resources and Environment, 2013, 22(4): 70-75. (in Chinese with English abstract)

2006

0.0

兰彦平, 顾万春. 北方地区皂荚种子及荚果形态特征的地理变异[J]. 林业科学, 2006, 42(7): 47-51.

LAN Y

, GU W

Geographical variation of morphologic characteristics of Gleditsia sinensis seeds and legumes in the north region[J]. Scientia Silvae Sinicae, 2006, 42(7): 47-51. (in Chinese with English abstract)

10 morphologic characteristic indexes of seeds and legumes in Gleditsia sinensis were investigated in 7 locations in China. The result showed: There were significant differences among morphologic characteristics of individual tree from the same population, and an extremely significant difference existed among those from different populations except width of legume, length of seed, and length to width ratio of legume. The mass, length, width and length to width ratio of legume showed a south-north variation at a same longitude; Width to thickness ratio of legume, and length to width ratio of seed were proved a west-east variation at a same latitude; Southwest_northeast variation existed at the thickness of legume, length of seed and length to width ratio of seed; There was no significant trend of geographic variation in 1 000 seeds' mass, which were mainly related to the altitude of distribution locations, water, solar radiation, the length of frost-free period and the burning hot.

对我国皂荚北方自然分布区7个产地采集的皂荚种子及部分荚果进行取样测定,分别测定荚果及种子10项形态指标,结果发现:各指标在同一群体不同家系间差异显著;不同群体间,除荚果宽、种子长、荚果长宽比外,其余指标差异均达显著或极显著水平;单荚果质量、荚果长度、荚果宽度及荚果长宽比表现为同地理经度上的南北变异;荚果宽厚比及种子长宽比,表现为同地理纬度的东西变异;荚果厚度、种子长度与种子长宽比表现为西南—东北向变异;种子千粒质量无明显的地理变异规律,主要与分布地点的海拔高度、水分、太阳辐射及炎热状况的综合作用有关。

2017

0.0

邢俊连, 孟艳琼, 林富荣, 等. 皂荚EST-SSR分子标记开发与分析评价[J]. 植物遗传资源学报, 2017, 18(1): 149-155.

XING J

, MENG Y

, LIN F

, et al. Development and assessment of EST-SSR for Gleditsia sinersis based on transcriptome sequences[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2017, 18(1): 149-155. (in Chinese with English abstract)

摘　要：本研究旨在开发皂荚EST-SSR分子标记,为今后皂荚种质资源评价与分析提供基础。首先通过对已公布的皂荚转录组数据进行拼接得到41003个Unigenes,总长度70.4 Mb,平均长度1716 bp,N50为2533 bp。进一步在7009个Unigenes中检测到8494个EST-SSR位点,其中1200条Unigenes含有2个及以上的SSR位点,复合型SSRs有369个。针对所有EST-SSR位点设计得到6494条特异性引物,随机挑选60个位点进行试验验证与分析,其中44对引物可扩增出特异性片段,17对具有多态性,PIC值范围为0.195～0.742,均值为0.501,且大部分多态性位点位于UTR区域。通过对皂荚近缘种进行跨种PCR扩增试验,结果显示在开发的44对有效引物中,9个近缘种美国皂荚、日本皂荚、绒毛皂荚、滇皂荚、华南皂荚、小果皂荚、野皂荚、肥皂荚和美国肥皂荚分别有32、31、23、24、7、40、25、18和18对引物可获得有效扩增片段,说明EST-SSR标记在皂荚近缘种之间具有良好的通用性。研究表明利用转录组数据挖掘的EST-SSR位点具有扩增稳定、多态性良好、近缘种间通用等优点,是林木物种开发分子标记的有效途径之一。

... 邢俊连等^[10]利用已公布的皂荚转录组数据设计得到6 494条EST-SSR特异性引物,并对其中部分引物进行了PCR扩增实验,结果证实这些引物在其近缘种间具有很高的通用性 ...

2017

0.0

李伟, 林富荣, 郑勇奇, 等. 10个南方皂荚群体遗传多样性的AFLP分析[J]. 林业科学研究, 2017, 30(1): 46-52.

, LIN F

, ZHENG Y

, et al. Genetic diversity of ten Gleditsia sinersis populations from southern China[J]. Forest Reserrch, 2017, 30(1): 46-52. (in Chinese with English abstract)

[目的]研究南方皂荚的遗传多样性和遗传结构现状,为制定有效的保护策略和育种策略提供理论依据。[方法]采用扩增片段长度多态性技术对供试的215份皂荚的遗传多样性及遗传距离进行分析。[结果]表明:检测到1 782个位点,其中,有1 389个为多态性位点,多态位点百分率为77.94%;皂荚各群体Shannon’s信息指数平均为0.256;Nei’s多样性指数平均为0.168,表明皂荚群体的遗传多样性偏低,皂荚群体间存在着一定的遗传分化;根据遗传距离UPGMA聚类分析,将10个群体划分为4大类。由遗传分化系数和分子方差分析结果发现,群体内的变异是皂荚遗传变异的主体,74.79%的变异来自群体内。[结论]皂荚群体的遗传多样性与遗传结构的形成不仅与其分布广泛、种子特性及生活史有关,而且与人为的砍伐、引种、生境片段化等因素有重要关系。基于上述结果提出了皂荚的保护策略。

... 李伟等^[11]利用AFLP分子标记技术对10个南方皂荚群体进行了遗传多样性研究,具体分析了皂荚群体遗传结构形成的原因,并提出了皂荚的保护策略 ...

2001

0.0

... SRAP即相关序列多态性扩增(Sequence-related amplification polymorphism),是由Li等^[12]开发的一种新型分子标记技术 ...

2015

0.0

龙治坚, 范理璋, 徐刚, 等. SCoT分子标记在植物研究中的应用进展[J]. 植物遗传资源学报, 2015, 16(2): 336-343.

LONG Z

, FAN L

, XU

, et al. Application advance of SCoT molecular markers in plants[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2015, 16(2): 336-343. (in Chinese with English abstract)

... 由于被扩增区域为真核基因的ORF,其本身可能是目的基因的一部分或与目的基因紧密连锁,因而能对性状进行有效跟踪^[13] ...

2014

0.0

李秀, 徐坤, 巩彪. 生姜种质遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析[J]. 中国农业科学, 2014, 47(4): 718-726.

, XU

, GONG

Genetic diversity and phylogenetic relationship of ginger germplasm resources revealed by SRAPs[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2014, 47(4): 718-726. (in Chinese with English abstract)

... SRAP标记在操作上类似于随机扩增多态性DNA标记(random amplified polymorphic DNA,RAPD),但其稳定性远优于RAPD技术,同时还克服了SSR技术(simple sequence repeats)标记引物开发的费时费力以及扩增片段长度多态性技术(amplified fragment length polymorphism,AFLP)复杂、成本昂贵等缺点^[14],它提供的信息比其他标记更接近于形态学性状的差异^[15] ...

2010

0.0

齐兰, 王文泉, 张振文, 等. 利用SRAP标记构建18个木薯品种的DNA指纹图谱[J]. 作物学报, 2010, 36(10): 1642-1648.

, WANG W

, ZHANG Z

, et al. DNA fingerprinting analysis of 18 cassava varieties using sequence-related amplified polymorphism markers[J]. Acta Agronomica Sinica, 2010, 36(10): 1642-1648. (in Chinese with English abstract)

There widely exists a case of same name for more varieties or different names for one variety in cassava agriculture production, so it is difficult to identifycassava varieties on the basis of the phenotypic characters. In the paper, SRAP marker was applied to detect 18 cassava varieties, thirty-six primer combinations were selected with abundant polymorphism, a total of 320 bands were scored, 235 (73.4%) out of them were polymorphic , with an average of 8.9 bands and 6.5 polymorphic bands for each primer combination, 235 polymorphic bands then were used to develop a dendrogram with Unweighted Pair-Group Method Arithmetic Average (UPGMA), and 18 cassava varieties were divided into four major groups at the 0.734 similarity level; two primer combinations Me1-Em5 and Me24-Em10, were used to develop the DNA fingerprints for the 18 cassava varieties. The DNA fingerprints were then converted into binary codes, with 1 and 0 representing band presence and absence, respectively. In the DNA fingerprints, each of the 18 cassava varieties had its unique binary code, which distinguished varieties between each other easily, with 99.999% probability of confidence. The results demonstrated that it is feasible to distinguish varieties with DNA fingerprints established by SRAP.

利用SRAP标记，选用36对多态性较好的引物组合，对18个木薯品种进行分析鉴定，扩增出320个位点，其中多态性位点235个，多态性比率达73.4%，平均每对引物组合可产生8.9个位点和6.5个多态性位点；235个多态性位点采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析，以遗传相似系数0.734为阈值，可将18份供试材料分为4组；选用2对多态性引物Me1-Em5和Me24-Em10，初步构建了18份木薯品种的指纹图谱，根据条带的有无转换为0、1二进制编码形成数字指纹，每个品种拥有唯一的数字指纹区别于其他品种，置信概率达到99.999%。结果表明，采用SRAP标记建立的指纹图谱适用于木薯品种的分类和鉴定。

2016

0.0

黄伟, 鲁敏, 张起, 等. 利用SRAP标记分析贵州砂梨资源遗传多样性[J]. 西北植物学报, 2016, 36(2): 280-287.

HUANG

, LU

, ZHANG

, et al. Genetic diversity of Pyrus pyrifolia resources in Guizhou Province using SRAP markers[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2016, 36(2): 280-287. (in Chinese with English abstract)

Genetic diversity and genetic relationship of 59 Pyrus pyrifolia germplasm resources distributed in Guizhou Province were analyzed using SRAP markers.The results showed that:(1)15 SRAP primer pairs generated 151 bands and 120 presented polymorphic loci.(2)A relatively high level of genetic diversity was revealed by Ne (mean observed number of alleles) 1.355 9, H (Nei’s genetic diversity) 0.216 9, I (Shannon’s information index)=0.336 2 at species level and by Ne =1.261 1, H =0.155 5, I =0.235 2 at population level.Pear resource in Qianxinan Prefecture showed the highest genetic diversity and that in Liupanshui City showed the lowest.(3)Cluster analysis with UPGMA method showed that 59 P.pyrifolia germplasms could be grouped into six groups at genetic coefficient of 0.75.The result also indicated that P.pyrifolia resources distributed in Guizhou Province had abundant genetic diversity with obvious geographical feature.The genetic diversity and genetic relationship of the P.pyrifolia germplasms could be revealed effectively by SRAP markers,which provided more genetic information in a smaller range of variation as compared to ISSR.

采用SRAP标记技术,对贵州59份砂梨种质的遗传多样性进行分析。结果表明:(1)筛选的15对SRAP引物共扩增出151个位点,其中120个是多态性位点,多态百分率为79.47%。(2)POPGENE分析表明,贵州砂梨资源在物种水平上有效等位基因数( Ne )为1.355 9,Nei’s基因多样性指数( H )为0.216 9,Shannon’s信息指数( I )为0.336 2;在区域品种群水平 Ne =1.261 1, H =0.155 5, I =0.235 2,以黔西南地区资源的遗传多样性最高,六盘水市最低。(3)聚类分析显示,在遗传相似系数0.75处,可将59份砂梨资源分为6个组,聚类分析结果具有一定的地理区域特性。研究认为,贵州砂梨种质具有较为丰富的遗传多样性,并表现出明显的地理区域特性;SRAP标记与ISSR标记在揭示贵州砂梨种质遗传多样性上具有高度的一致性,但SRAP标记能在更小的变异范围内揭示更多的遗传信息。

... 目前,SRAP标记已广泛应用于植物的遗传多样性分析、品种鉴定、遗传图谱绘制等研究中^[16,17,18] ...

2016

0.0

李志强, 党志国, 赵志常, 等. 芒果杂交F₁代群体的遗传多样性分析及遗传图谱的构建[J]. 分子植物育种, 2016, 14(4): 953-958.

LI Z

, DANG Z

, ZHAO Z

, et al. Genetic diversity analyze of mango's F₁ hybrids and construction of genetic map[J]. Molecular Plant Breeding, 2016, 14(4): 953-958. (in Chinese with English abstract)

... 目前,SRAP标记已广泛应用于植物的遗传多样性分析、品种鉴定、遗传图谱绘制等研究中^[16,17,18] ...

2014

0.0

马胜超, 韩睿, 任鹏鸿, 等. 三十份菊芋资源亲缘关系的SRAP分析[J]. 浙江农业学报, 2014, 26(5): 1212-1217.

MA S

, HANG

, REN P

, et al. Analysis of genetic relationship of 30 Jerusalem artichoke germplasm resources by SRAP markers[J]. Acta Agriculturae Zhejiangensis, 2014, 26(5): 1212-1217. (in Chinese with English abstract)

摘　要：利用SRAP分子标记技术对30份菊芋资源进行了基因组多态性分析。用22对扩增稳定且清晰的具有多态性DNA条带的引物组合,进行菊芋的SRAP-PCR扩增。共扩增出160条条带,其中多态性条带114条,多态性比率为71%,表明菊芋资源在DNA水平上存在广泛差异。利用NTSYS软件统计分析出资源间遗传距离在0.04～0.42之间。应用UPGMA得出聚类结果,将30份菊芋资源划分为2大类群,第2大类群分为6个亚类群。聚类结果与传统的形态学分类略有不同,可结合两种方法为菊芋资源亲缘关系的研究提供理论基础。

... 目前,SRAP标记已广泛应用于植物的遗传多样性分析、品种鉴定、遗传图谱绘制等研究中^[16,17,18] ...

2009

0.0

张安世, 邢智峰, 刘永英, 等. 苔藓植物DNA不同提取方法的比较分析[J]. 河南科学, 2009, 27(5): 559-562.

ZHANG A

, XING Z

, LIU Y

, et al. Comparison and analysis on the different methods of DNA extration methods from bryophytes[J]. Henan Science, 2009, 27(5): 559-562. (in Chinese with English abstract)

以苔藓植物为材料,比较快速提取法,SDS法和改良CTAB法 (自行设计)提取苔藓植物总DNA的效果.结果表明:改良CTAB法提取的基因组DNA质量最好(A260/A280为1.83～1.86;A260 /A230为2.05～2.50),快速提取法次之(A260/A280为1.64～1.73;A260/A230为1.68～1.77),SDS法较差 A260/A为1.51～1.61;A260/A230为1.56～1.76).改良CTAB法提取的苔藓植物的DNA适合于作为PCR的模板,并成功地进行了RAPD扩增.

... 2 皂荚基因组DNA的提取每个皂荚品种选3株,每株取1片幼嫩叶片等量混合,采用改良CTAB法^[19]提取皂荚基因组DNA,并将模板DNA浓度稀释至20 ng#cod#x000b7 ...

2014

0.0

黄秀, 曾捷, 聂刚, 等. 牛鞭草品EST-SS指纹图谱构建及遗传多样性分析[J]. 热带亚热带植物学报, 2014, 22(2): 165-171.

HUANG

, ZENG

, NIE

, et al. Construction of fingerprinting and genetic diversity analysis of Hemarthia cultivars by EST-SSR[J]. Journal of Tropical & Subtropical Botany, 2014, 22(2): 165-171. (in Chinese with English abstract)

In order to understand the genetic diversity of Hemarthria cultivars, the DNA fingerprints of six Hemarthia cultivars were constructed by using 8 pairs of EST-SSR primers screened from 86 pairs, and the genetic diversities among them were analyzed. The results showed that eight pairs of ESR-SSR primers totally amplified 194 bands, in which 161 bands were polymorphic bands, accounting for 83.4%. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.480 to 0.695, with an average of 0.602. The UPGMA analysis showed that six cultivars of Hemarthia could be divided into two groups at the similarity coefficient of 0.652, and 6 cultivars could be completely separated by eight pairs of ESR-SSR primers. Based on electrophoretogram amplified by 3 pairs primers, the standard DNA fingerprinting for 6 Hemarthia cultivars were constructed, and each cultivars had an unique fingerprint. The average Nei's genetic diversity and Shannon's information index were 0.333 and 0.496, respectively. The similarity coefficient of 6 cultivars of Hemarthia ranged from 0.399 to 0.782. Therefore, it was suggested that 6 cultivars of Hemarthia had rich genetic diversity and significant differences between species.

为探讨牛鞭草（ Hemarthria spp.）品种间的遗传多样性，从86 对EST-SSR 引物中筛选出8 对引物对牛鞭草属6 个品种进行指纹图谱的构建及遗传多样性分析。结果表明，8 对EST-SSR 引物对牛鞭草属6 个品种共扩增出193 条清晰条带，多态性条带161 条，多态性比例为83.4%。每条引物的多态信息含量（PIC）为0.480 ~ 0.695，平均为0.602。UPGMA 聚类分析表明，牛鞭草属6 个品种在相似系数为0.652 处可分为两大类群。8 对EST-SSR 引物均能将6 个品种完全区分开，以3 对EST-SSR 引物扩增的电泳图谱为基础，建立了牛鞭草属6 个品种的指纹图谱标准模式图，每个品种都有唯一的指纹图谱。牛鞭草属6 个品种的平均Nei’s 基因多样性指数为0.333，平均Shannon 信息指数为0.496，品种间的相似系数介于0.399 ~ 0.782 之间。可见，牛鞭草属植物品种的遗传多样性较丰富，种间差异明显。

... 32软件进行多态性百分率(PPL)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性(H)和Shannon's多样性指数(I)等遗传多样性参数分析,依据黄秀等^[20]方法计算引物多态性信息含量(PIC),通过NTSYS-pc 2 ...

2013

0.0

... 0软件依据UPGMA法进行聚类分析,同时,参照云天海等^[21]方法构建18份皂荚种质材料的DNA指纹图谱 ...

2013

0.0

林清, 龙治坚, 韩国辉, 等. 基于SCoT标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱[J]. 中国蔬菜, 2013 (12): 31-39.

LIN

, LONG Z

, HAN G

, et al. Genetic diversity and fingerprint based on SCoT markers in Brassica juncea(L. ) Czern. et Coss. [J]. China Vegetables, 2013 (12): 31-39. (in Chinese with English abstract)

利用SCoT标记对46份芥菜种质资源进行遗传多样性分析.从70条引物中筛选出21条用于PCR扩增,共扩增出200条条带,其中多态性条带140条,多态性比率为70%.供试材料相似系数介于0.77~0.95之间,平均Nei’s基因多样性为0.198,平均Shannon信息指数为0.301,平均多态信息含量为0.8227.利用UPGMA构建46份芥菜种质资源的聚类树状图,在相似系数D1=0.780处,可以将46份芥菜种质分为两大类;而在D2=0.807处,第Ⅱ类可进一步细分为5个亚类.选出清晰的16个多态性位点,构建46份芥菜种质的SCoT指纹图谱,结果由引物SP4、SP19、SP20、SP23、SP30所构建的DNA指纹图谱可将供试材料完全区分开.

... 1 皂荚种质资源的遗传多样性分析SRAP作为一种新型目的基因分子标记(Gene targeted markers,GTMs),可以对性状进行跟踪,被认为是在分子标记辅助育种中最可能被大规模应用的一种技术^[22] ...

2015

0.0

徐玉仙, 张微微, 莫海波, 等. 基于EST-SSR标记的莲属种质资源遗传多样性分析[J]. 植物分类与资源学报, 2015, 37(5): 595-604.

XU Y

, ZHANG W

, MO H

, et al. Genetic diversity analysis of Nelumbo accessions based on EST-SSR markers[J]. Plant Diversity and Resources, 2015, 37(5): 595-604. (in Chinese with English abstract)

... 25)^[23],说明本试验筛选的引物具有较高的多态性,可以有效地用于皂荚的遗传多样性分析 ...

2015

0.0

唐源江, 曹雯静, 吴坤林. 基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建[J]. 中国农业科学, 2015, 48(9): 1795-1806.

TANG Y

, CAO W

, WU K

Genetic diversity analysis and molecular identification card construction of Chinese cymbidium germplasms based on SRAP markers[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2015, 48(9): 1795-1806. (in Chinese with English abstract)

... 如唐源江等^[24]利用17对SRAP引物扩增的48条谱带构建了139份国兰样本的DNA分子身份证,置信概率达99 ...

2012

0.0

刘君, 赵琴, 杨志民. SRAP分子标记对九个狗牙根品种的鉴定分析[J]. 中国草地学报, 2012, 34(4): 21-25.

LIU

, ZHAO

, YANG Z

Identification of nine Cynodon dactylon varieties by SRAP molecular markers[J]. Chinese Journal of Grassland , 2012, 34(4): 21-25. (in Chinese with English abstract)

摘　要：以9个常用狗牙根品种为对象,利用SRAP标记对其亲缘关系进行研究,构建了9份材料的指纹图谱。结果显示,从25对引物中最终筛选出10对引物组合,共扩增出230条清晰的条带,其中154条为多态性条带,平均多态性条带百分率为66.96%,材料间的遗传相似系数范围在0.606到0.867之间,变幅为0.261,说明9个狗牙根亲缘关系较近,较难区分;UPGMA聚类分析结果显示材料可聚为2类,T-419、小矮人与老鹰草聚为一类,其他6个品种聚为一类,这表明坪用性状表现相近的草坪草品种有聚类在一起的趋势。利用引物对em4-em6和me1-em6的扩增产物电泳图为基础构建的指纹图谱可以鉴定出9个狗牙根品种。

... 刘君等^[25]利用2对SRAP引物构建的指纹图谱,可以将9个狗牙根品种进行准确鉴别 ...

2011

0.0

徐宗大, 赵兰勇, 张玲, 等. 玫瑰SRAP遗传多样性分析与品种指纹图谱构建[J]. 中国农业科学, 2011, 44(8): 1662-1669.

XU Z

, ZHAO L

, ZHANG

, et al. Analysis of genetic diversity and construction of fingerprint of Rosa rugosa by SRAP[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2011, 44(8): 1662-1669. (in Chinese with English abstract)

【目的】从分子水平分析玫瑰的遗传多样性和亲缘关系,并建立玫瑰品种的指纹图谱,为杂交育种、品种分类和品种鉴定提供理论依据。【方法】采用相关序列扩增多态性(SRAP)技术对玫瑰46个品种和4份野生种质进行遗传多样性分析和品种指纹图谱的构建。【结果】15对引物共扩增出264个位点,其中227个为多态性位点,多态性比率为85.98%,说明玫瑰的遗传多样性较为丰富。50份材料的遗传相似系数(GS)为0.6012—0.9852,平均值为0.7835;平均Nei’s遗传多样性指数(H)为0.2665,平均Shannon信息指数(I)为0.4033;4份野生玫瑰种质的H=0.1225,I=0.1787,显著低于栽培品种的H=0.2684,I=0.4059,说明玫瑰品种的遗传多样性更为丰富。【结论】根据聚类结果,玫瑰品种类型的划分应首先考虑亲本来源,再按株型、花型划分。利用3对核心引物Me1-Em8、Me2-Em7和Me8-Em9,构建了玫瑰品种的标准指纹图谱,可为品种鉴定提供依据。

... 徐宗大等^[26]从100对引物中筛选出了可准确鉴别46个品种的3对SRAP核心引物Me1-Em8、Me2-Em7和Me8-Em9,构建了玫瑰品种的指纹图谱,可对46个玫瑰品种和4份野生种质进行准确鉴定 ...