奶牛隐性乳房炎三种致病菌的多重PCR检测方法的建立
王宇, 李碧, 阳明贤, 左之才*
四川农业大学 动物医学院,环境公害与动物疾病四川省高校重点实验室,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川 雅安 625014
*通信作者,左之才,E-mail: zzcjl@126.com

作者简介:王宇(1994—),男,土家族,湖南湘西人,硕士研究生,研究方向为中西兽医与临床。E-mail:564047961@qq.com

摘要

为建立快速并能同时检测无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌3种奶牛隐性乳房炎致病菌的方法,根据无乳链球菌16S rRNA基因、金黄色葡萄球菌 NUC耐热基因、绿脓杆菌 ETA基因序列并参考文献各合成一对特异性引物,通过对PCR反应各项参数的调整优化,建立多重PCR检测体系,并同时进行灵敏性试验和特异性试验。结果显示:该检测方法可以同时扩增出无乳链球菌270 bp、金黄色葡萄球菌153 bp和绿脓杆菌375 bp的特异性片段以及细菌16S rRNA 1 500 bp的通用片段,而对于其他的6种病原菌只能扩增出1 500 bp的通用片段,具有较强的特异性。三种特异性引物扩增条带与GenBank上的细菌基因序列同源性为99%。增菌培养24 h,该体系对无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌的最低灵敏度分别为8×104、4×104、1.5×105 CFU·mL-1。本研究建立的检测方法能够完成无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌的快速检测,对于生产上奶牛隐性乳房炎的鉴别诊断和快速检测具有重大意义。

关键词: 奶牛隐性乳房炎; 无乳链球菌; 金黄色葡萄球菌; 绿脓杆菌; 多重PCR
中图分类号:S858.24 文献标志码:A 文章编号:1004-1524(2019)01-0020-10
Establishment of a multiplex PCR assay for three pathogenic bacteria in cows with recessive mastitis
WANG Yu, LI Bi, YANG Mingxian, ZUO Zhicai*
College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University, Environmental Pollution and Animal Diseases of Sichuan Provincial Key Laboratory of Colleges and Universities, Sichuan Key Laboratory of Animal Diseases and Human Health, Ya'an 625014, China
Abstract

In order to establish a method for the rapid and simultaneous detection of three pathogenic bacteria of mastitis of Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa, three pairs of specific primers were synthesized based on the Streptococcus agalactiae 16S rRNA gene, Staphylococcus aureus NUC heat-resistance gene, Pseudomonas aeruginosa ETA gene sequence and references. By adjusting and optimizing the parameters of the PCR reaction, a multiplex PCR detection system was established, and the sensitivity test and specificity test were simultaneously performed. The results showed that the detection method can simultaneously amplify specific fragments of 270 bp of Streptococcus agalactiae, 153 bp of Staphylococcus aureus and 375 bp of Pseudomonas aeruginosa and a generic 1 500 bp fragment of bacterial 16S rRNA. For other six kinds of pathogenic bacteria, only 1 500 bp universal fragments could be amplified, which had strong specificity. Three specific primer amplification bands were 99% homologous to the GenBank and bacterial gene sequences. After culture for 24 h, the minimum sensitivity of the system to Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa was 8×104, 4×104 and 1.5×105 CFU·mL-1, respectively. The detection method established in this study can complete the rapid detection of Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa, and is of great significance for the differential diagnosis and rapid detection of subclinical mastitis in dairy cows.

Keyword: dairy subclinical mastitis; Streptococcus agalactiae; Staphylococcus aureus; Pseudomonas aeruginosa; multiplex PCR

奶牛隐性乳房炎是一种奶牛乳房与乳汁均没有临床肉眼可见症状和病理变化的非临床型乳房炎[1], 它发病范围广(全世界奶牛场均有发生), 感染率高, 极易发展为临床型乳房炎而导致奶牛的淘汰[2]。最为常见的隐性乳房炎病原是金黄色葡萄球菌、无乳链球菌, 极具危害性的病原是绿脓杆菌[1, 3]。目前, 对于隐性乳房炎的主流检测方法是细胞学检测, 根据乳汁中体细胞数含量的多少来判断是否患有隐性乳房炎[4]。这种方法是不完善的, 缺点是结果判定的主观性较强, 容易出现主观误差[5]。目前, 国内外对临床样本中病原菌的检验大多沿用细菌培养及鉴定方法, 检验步骤繁琐, 周期较长, 需要将病原菌从样本中分离纯化出来, 才能作进一步的鉴定, 难以满足临床需求。

聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)技术能弥补微生物学培养和生化方法进行细菌分离鉴定的局限性, 是一种新的分子水平细菌分类和鉴定方法, 在医学和兽医学临床诊断中有很广阔的前景。多重PCR(multiplex PCR)技术因具有高效快捷、特异敏感、实验成本低等优点而得到广泛应用。1988年, Chamberlain等[6]首先使用多重PCR技术对人的杜氏营养不良症(DMD)进行检测, 随后, 多重PCR技术在动物疫病检测方面得到了广泛的应用和发展。QIAGEN公司研制出适于多重PCR反应的新型缓冲系统, 并已研制出多重PCR试剂盒, 可以直接用于相关基因的检测分析。国内运用该技术检测病原菌已日渐成熟, 在临床诊断方法已经取得一些较有意义的结果。覃芳芸等[7]分别根据链球菌属特异性gdh、猪链球菌种特异性16S rRNA和猪链球菌2型特异性cps2J等基因设计3对特异性引物, 在猪链球菌病的临床诊断上取得了一定的成果。与传统的细菌学培养法相比, 马保臣等[8]建立的检测乳房炎病原菌的多重PCR方法对金黄色葡萄球菌和酵母真菌具有更高的检出率。

目前, 乳汁病原微生物检查、普通PCR、实时荧光定量PCR、环介导等温扩增(LAMP)、基因芯片、凝集法等均应用于细菌检测领域[9]。但奶牛隐性乳房炎经常出现多种病原混合感染的情况, 以上的方法检测通量均不高。为此, 本研究拟建立无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌多重PCR检测体系, 以期为奶牛隐性乳房炎快速诊断提供技术支持。

1 材料与方法
1.1 材料

1.1.1 菌株

金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、绿脓杆菌(分离于隐性乳房炎奶牛)、芽孢杆菌、大肠埃希菌、粪球菌、柠檬酸杆菌、不动杆菌、腐生葡萄球菌(分离于隐性乳房炎奶牛)由四川农业大学动物医学院提供。

1.1.2 主要试剂与仪器

主要试剂有:TSA肉汤培养基、TSA琼脂培养基、KF培养基、卵黄甘露醇高盐培养基、伊红美蓝培养基、脑心浸液肉汤、Taq酶等。主要仪器有:NanoDrop2000超微量分光光度计、高压灭菌锅、PCR仪器、电泳仪、超净工作台、光学显微镜等。

1.2 方法

1.2.1 引物的设计与合成

根据GenBank上发表的无乳链球菌16S rRNA基因(GenBank登录号为X59032.1)、金黄色葡萄球菌NUC基因(GenBank登录号为DQ507382.1)、绿脓杆菌ETA基因(GenBank登录号为KC847702.1)并参考文献各设计一对特异性引物, 由生工生物工程(上海)股份有限公司合成(表1)。

表1 引物名称、序列、扩增片段大小 Table 1 Name of primers, primer sequences and size of product

1.2.2 细菌基因组DNA的提取

按照Ezup柱式细菌基因组DNA抽提试剂盒说明书操作(上海生工公司), 提取细菌DNA模板, 置-20 ℃保存。

1.2.3 单一PCR检测的条件优化

单一PCR的反应体系是50 μ L, 其中初始值是Taq酶的混合物(Mix)25 μ L、上游引物和下游引物各1 μ L(10 mmol· L-1)、细菌DNA 2 μ L、双蒸水21 μ L。跟据实际情况, 调整引物浓度(10~100 mmol· L-1)、细菌DNA浓度、酶(Mix)的浓度等变量。PCR反应条件为:95 ℃ 5 min; 95 ℃ 1 min, 退火温度50 ℃ 30 s, 72 ℃ 30 s, 35个循环; 72 ℃ 7 min。

1.2.4 多重PCR反应条件优化与体系的建立

双重PCR模板:以金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌的基因组DNA为模板, 各加入1 μ L DNA(金黄色葡萄球菌DNA浓度为59.7 ng· μ L-1、绿脓杆菌DNA浓度为50 ng· μ L-1); 以无乳链球菌与金黄色葡萄球菌的基因组DNA为模板, 按2∶ 1加入无乳链球菌DNA 2 μ L, 金黄色葡萄球菌DNA 1 μ L(金黄色葡萄球菌DNA浓度为59.7 ng· μ L-1、无乳链球菌DNA浓度为66.8 ng· μ L-1); 以无乳链球菌与绿脓杆菌的基因组DNA为模板, 加入无乳链球菌DNA 2 μ L, 绿脓杆菌DNA 1 μ L(无乳链球菌DNA浓度为66.8 ng· μ L-1、绿脓杆菌DNA浓度为50 ng· μ L-1)。多重PCR模板:绿脓杆菌与金黄色葡萄球菌基因组DNA模板各1 μ L(金黄色葡萄球菌DNA浓度为59.7 ng· μ L-1、绿脓杆菌DNA浓度为50 ng· μ L-1)、无乳链球菌基因组DNA模板2 μ L(DNA浓度为66.8 ng· μ L-1)。

根据单重PCR优化结果, 以无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌3种菌的基因组DNA为常量, 退火温度(42~62 ℃)、引物浓度、Mix浓度为变量, 95 ℃ 5 min; 95 ℃ 1 min, 退火温度42~62 ℃(梯度PCR) 30 s, 72 ℃ 30 s, 35个循环; 72 ℃ 7 min; 以确定最佳反应条件。

1.2.5 三重PCR的重复性试验

多重PCR优化完成后, 根据优化完成的条件体系进行5次重复性试验。

1.2.6 PCR检测的特异性试验

在完成PCR检测的优化之后, 对其进行特异性检验。在相同的条件和引物(加入特异性引物与16S rRNA通用引物)下分别对金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、绿脓杆菌与阴性对照组(大肠埃希菌、粪球菌、假单孢菌、表皮葡萄球菌、腐生葡萄球菌、不动杆菌)进行PCR反应, 反应条件体系应用优化完成的(先单一PCR反应, 再双重PCR反应, 最后三重PCR反应), 重复试验2次, 检测其特异性。

1.2.7 PCR检测的灵敏性试验

对无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌进行菌液浓度测定, 计算1 mL菌液的浓度。将计算好的1 mL菌液进行DNA提取, 稀释成10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6 6个浓度梯度分别为模板进行PCR反应, 反应条件体系应用优化完成的(先单一PCR反应, 再双重PCR反应, 最后三重PCR反应), 检测其灵敏性。

1.2.8 PCR产物电泳检测

PCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳检测, 电压为120 V, 时间30 min。

2 结果与分析
2.1 多重PCR优化结果

多重PCR最佳反应条件为(50 μ L体系):25 μ L的Mix、3种细菌特异性引物的上游和下游引物各1 μ L、绿脓杆菌与金黄色葡萄球菌基因组DNA模板各1 μ L(金黄色葡萄球菌DNA浓度为59.7 ng· μ L-1、绿脓杆菌DNA浓度为50 ng· μ L-1)、无乳链球菌基因组DNA模板2 μ L(DNA浓度为66.8 ng· μ L-1)、15 μ L的双蒸水。反应程序为:95 ℃ 5 min; 95 ℃ 30 s、56.9 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s, 35个循环; 72 ℃ 7 min; 12 ℃保存(图1)。

图1 单重PCR与多重PCR结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~2, 金黄色葡萄球菌; 3~4, 无乳链球菌; 5~6, 绿脓杆菌; 7~8, 无乳链球菌与金黄色葡萄球菌; 9~10, 金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌; 11~12, 绿脓杆菌与无乳链球菌; 13~14, 无乳链球菌、金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌; 15~16, 阴性对照组。
Fig.1 Single and multiplex PCR results
M, DNA marker DL2000; 1-2, S. aureus; 3-4, S. agalactiae; 5-6, P. aeruginosa; 7-8, S. agalactiae and S. aureus; 9-10, S. aureus and P. aeruginosa; 11-12, P. aeruginosa and S. agalactiae; 13-14, S. agalactiae, S. aureus and P. aeruginosa; 15-16, Negative control group.

2.2 PCR特异性结果

2.2.1 无乳链球菌特异性结果

无乳链球菌与芽孢杆菌、大肠埃希菌、粪球菌、柠檬酸杆菌、不动杆菌、腐生葡萄球菌在相同的条件下加入无乳链球菌特异性引物与16S rRNA通用引物进行PCR反应, 结果具有高特异性(图2)。

图2 无乳链球菌特异性试验结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~2, 无乳链球菌; 3, 芽孢杆菌; 4, 大肠埃希菌; 5, 粪球菌; 6, 柠檬酸杆菌; 7, 不动杆菌; 8, 腐生葡萄球菌。1~8均加入无乳链球菌特异性引物与16S通用引物。
Fig.2 Specificity test results for S. agalactiae
M, DNA marker DL2000; 1-2, S. agalactiae; 3, Bacillus; 4, E. coli; 5, Dungococcus; 6, Citrobacter; 7, Acinetobacter; 8, Staphylococcus saprophyticus. 1-8 were added with S. agalactiae-specific primers and 16S universal primers.

2.2.2 绿脓杆菌特异性结果

绿脓杆菌与芽孢杆菌、大肠埃希菌、粪球菌、柠檬酸杆菌、不动杆菌、腐生葡萄球菌在相同的条件下加入绿脓杆菌特异性引物与16S通用引物进行PCR反应, 结果具有高特异性(图3)。

图3 绿脓杆菌特异性试验结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~2, 绿脓杆菌; 3, 芽孢杆菌; 4, 大肠埃希菌; 5, 粪球菌; 6, 柠檬酸杆菌; 7, 不动杆菌; 8, 腐生葡萄球菌。1~8均加入绿脓杆菌特异性引物与16S通用引物。
Fig.3 Specific test results for P. aeruginosa
M, DNA marker DL2000; 1-2, P. aeruginosa; 3, Bacillus; 4, E. coli; 5, Dungococcus; 6, Citrobacter; 7, Acinetobacter; 8, Staphylococcus saprophyticus. 1-8 were added with P. aeruginosa-specific primers and 16S universal primers.

2.2.3 金黄色葡萄球菌特异性结果

金黄色葡萄球菌与芽孢杆菌、大肠埃希菌、粪球菌、柠檬酸杆菌、不动杆菌、腐生葡萄球菌在相同的条件下加入金黄色葡萄球菌特异性引物与16S通用引物进行PCR反应, 结果具有高特异性(图4)。

图4 金黄色葡萄球菌特异性试验结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~2, 金黄色葡萄球菌; 3, 芽孢杆菌; 4, 大肠埃希菌; 5, 粪球菌; 6, 柠檬酸杆菌; 7, 不动杆菌; 8, 腐生葡萄球菌。1~8均加入金黄色葡萄球菌特异性引物与16S通用引物。
Fig.4 Specific test results for Staphylococcus aureus
M, DNA marker DL2000; 1-2, S. aureus; 3, Bacillus; 4, E. coli; 5, Dungococcus; 6, Citrobacter; 7, Acinetobacter; 8, Staphylococcus saprophyticus. 1-8 were added with S. aureus-specific primers and 16S universal primers.

2.2.4 无乳链球菌与金黄色葡萄球菌双重PCR的特异性结果

无乳链球菌与金黄色葡萄球菌双重PCR具有高特异性(图5)。

图5 无乳链球菌与金黄色葡萄球菌双重PCR的特异性结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~2, 金黄色葡萄球菌与无乳链球菌; 3, 芽孢杆菌; 4, 大肠埃希菌; 5, 芽孢杆菌与大肠埃希菌。1~5均加入金黄色葡萄球菌与无乳链球菌的特异性引物、16S通用引物。
Fig.5 Dual-PCR specific results for S. agalactiae and S. aureus
M, DNA marker DL2000; 1-2, S. agalactiae and S. aureus; 3, Bacillus; 4, E. coli; 5, Bacillus and E. coli. 1-5 were added with specific primers for S. agalactiae and S. aureus, as well as 16S universal primers.

2.2.5 无乳链球菌与绿脓杆菌双重PCR的特异性结果

无乳链球菌与绿脓杆菌双重PCR与阴性对照相比具有高特异性(图6)。

图6 无乳链球菌与绿脓杆菌双重PCR的特异性结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~2, 无乳链球菌与绿脓杆菌; 3, 粪球菌; 4, 柠檬酸杆菌; 5, 粪球菌加柠檬酸杆菌。1~5均加入无乳链球菌与绿脓杆菌的特异性引物, 16S通用引物。
Fig.6 Dual-PCR specific results for S. agalactiae and P. aeruginosa
M, DNA marker DL2000; 1-2, S. agalactiae and P. aeruginosa; 3, Dungococcus; 4, Citrobacter; 5, Dungococcus and Citrobacter. 1-5 were added with specific primers for S. agalactiae and P. aeruginosa, as well as 16S universal primers.

2.2.6 金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌双重PCR的特异性结果

金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌双重PCR与阴性对照相比具有高特异性(图7)。

图7 金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌双重PCR的特异性结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~2, 金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌; 3, 不动杆菌; 4, 腐生葡萄球菌; 5, 不动杆菌加腐生葡萄球菌。1~5均加入金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌的特异性引物与16S通用引物。
Fig.7 Dual-PCR specific results for S. aureus and P. aeruginosa
M, DNA standard DL2000; 1-2, S. aureus and P. aeruginosa; 3, Acinetobacter; 4, Staphylococcus saprophyticus; 5, Acinetobacter and Staphylococcus saprophyticus; 1-5 were added with specific primers for S. aureus and P. aeruginosa, as well as 16S universal primers.

2.2.7 无乳链球菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌多重PCR特异性试验结果

无乳链球菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌多重PCR与阴性对照相比具有高特异性(图8)。

图8 无乳链球菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌多重PCR特异性试验结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~2, 无乳链球菌加金黄色葡萄球菌加绿脓杆菌; 3, 芽孢杆菌加大肠埃希菌加粪球菌; 4, 不动杆菌加腐生葡萄球菌加柠檬酸杆; 5, 芽孢杆菌加大肠埃希菌加不动杆菌; 6, 不动杆菌加腐生葡萄球菌加大肠埃希菌; 7, 芽孢杆菌加大肠埃希菌加腐生葡萄球菌; 8, 不动杆菌加腐生葡萄球菌加芽孢杆菌。1~8均加入无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌的特异性引物与16S通用引物。
Fig.8 Multiplex PCR specific test results for S. agalactiae, P. aeruginosa and S. aureus
M, DNA marker DL2000; 1-2, S. agalactiae, S. aureus and P. aeruginosa; 3, Bacillus, E. coli and Dungococcus; 4, Acinetobacter, Staphylococcus saprophyticus and Citrobacter; 5, Bacillus, E. coli and Acinetobacter ; 6, Acinetobacter, Staphylococcus saprophyticus and E. coli; 7, Bacillus, E. coli and Staphylococcus saprophyticus; 8, Acinetobacter and Staphylococcus saprophyticus and Bacillus. 1-8 were added with 4 primers including S. agalactiae, S. aureus, P. aeruginosa-specific primers and 16S universal primers.

2.3 PCR灵敏性试验结果

2.3.1 单重PCR灵敏性试验结果

无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌在1 mL脑心浸液肉汤37 ℃培养24 h后经过菌落计数测出浓度分别为8× 107、4× 107、1.5× 109 CFU· mL-1。无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌1 mL菌液经试剂盒抽提DNA, 用NanoDrop2000超微量分光光度计测定DNA浓度, 分别为66.8、59.7、50.0 ng· μ L-1。无乳链球菌的灵敏性在8× 104 CFU· mL-1-6.68× 10-2 ng· μ L-1、金黄色葡萄球菌的灵敏性在4× 104 CFU· mL-1-5.97× 10-2ng· μ L-1、绿脓杆菌的灵敏性在1.5× 105 CFU· mL-1-5× 10-3 ng· μ L-1(图9-图11)。

图9 无乳链球菌灵敏性试验结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1, 8× 106 CFU· mL-1-6.68× 100 ng· μ L-1; 2, 8× 105 CFU· mL-1-6.68× 10-1 ng· μ L-1; 3, 8× 104 CFU· mL-1-6.68× 10-2 ng· μ L-1; 4, 8× 103 CFU· mL-1-6.68× 10-3 ng· μ L-1; 5, 8× 102 CFU· mL-1-6.68× 10-4ng· μ L-1; 6, 8× 101 CFU· mL-1-6.68× 10-5 ng· μ L-1; 7, 阴性对照。
Fig.9 Sensitivity test results for S. agalactiae
M, DNA marker DL2000; 1, 8× 106 CFU· mL-1-6.68× 100 ng· μ L-1; 2, 8× 105 CFU· mL-1-6.68× 10-1 ng· μ L-1; 3, 8× 104 CFU· mL-1-6.68× 10-2 ng· μ L-1; 4, 8× 103 CFU· mL-1-6.68× 10-3 ng· μ L-1; 5, 8× 102 CFU· mL-1-6.68× 10-4 ng· μ L-1; 6, 8× 101 CFU· mL-1-6.68× 10-5 ng· μ L-1; 7, Negative control.

图10 绿脓杆菌灵敏性试验结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1, 1.5× 108 CFU· mL-1-5× 100 ng· μ L-1; 2, 1.5× 107 CFU· mL-1-5× 10-1 ng· μ L-1; 3, 1.5× 106 CFU· mL-1-5× 10-2 ng· μ L-1; 4, 1.5× 105 CFU· mL-1-5× 10-3ng· μ L-1; 5, 1.5× 104 CFU· mL-1-5× 10-4 ng· μ L-1; 6, 1.5× 103 CFU· mL-1-5× 10-5 ng· μ L-1; 7, 阴性对照。
Fig.10 Sensitivity test results for P. aeruginosa
M, DNA marker DL2000; 1, 1.5× 108 CFU· mL-1-5× 100 ng· μ L-1; 2, 1.5× 107 CFU· mL-1-5× 10-1 ng· μ L-1; 3, 1.5× 106 CFU· mL-1-5× 10-2 ng· μ L-1; 4, 1.5× 105 CFU· mL-1-5× 10-3 ng· μ L-1; 5, 1.5× 104 CFU· mL-1-5× 10-4 ng· μ L-1; 6, 1.5× 103 CFU· mL-1-5× 10-5 ng· μ L-1; 7, Negative control.

图11 金黄色葡萄球菌灵敏性试验
M, DNA分子量标准DL2000; 1, 4× 106 CFU· mL-1-5.97× 100 ng· μ L-1; 2, 4× 105 CFU· mL-1-5.97× 10-1 ng· μ L-1; 3, 4× 104 CFU· mL-1-5.97× 10-2ng· μ L-1; 4, 4× 103 CFU· mL-1-5.97× 10-3 ng· μ L-1; 5, 4× 102 CFU· mL-1-5.97× 10-4ng· μ L-1; 6, 4× 101 CFU· mL-1-5.97× 10-5 ng· μ L-1; 7, 阴性对照。
Fig.11 Sensitivity test results for S. aureus
M, DNA marker DL2000; 1, 4× 106 CFU· mL-1-5.97× 100 ng· μ L-1; 2, 4× 105 CFU· mL-1-5.97× 10-1 ng· μ L-1; 3, 4× 104 CFU· mL-1-5.97× 10-2ng· μ L-1; 4, 4× 103 CFU· mL-1-5.97× 10-3 ng· μ L-1; 5, 4× 102 CFU· mL-1-5.97× 10-4ng· μ L-1; 6, 4× 101 CFU· mL-1-5.97× 10-5 ng· μ L-1; 7, Negative control.

2.3.2 多重PCR灵敏性试验结果

无乳链球菌与金黄色葡萄球菌双重PCR在稀释度10-2处能检出基因条带。无乳链球菌与绿脓杆菌双重PCR在稀释度10-3处能检出基因条带。绿脓杆菌与金黄色葡萄球菌双重PCR在稀释度10-2处能检出基因条带。无乳链球菌与绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌的多重PCR在稀释度10-3处能检出基因条带(图12)。

图12 多重PCR灵敏性试验结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1, 无乳链球菌与金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-1的双重PCR; 2, 无乳链球菌与金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-2的双重PCR; 3, 无乳链球菌与金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-3的双重PCR; 4, 无乳链球菌与绿脓杆菌稀释梯度为10-1的双重PCR; 5, 无乳链球菌与绿脓杆菌稀释梯度为10-2的双重PCR; 6, 无乳链球菌与绿脓杆菌稀释梯度为10-3的双重PCR; 7, 绿脓杆菌与金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-1的双重PCR; 8, 绿脓杆菌与金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-2的双重PCR; 9, 绿脓杆菌与金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-3的双重PCR; 10, 无乳链球菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-1的多重PCR; 11, 无乳链球菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-2的多重PCR; 12, 无乳链球菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌稀释梯度为10-3的多重PCR; 13~16, 阴性对照。
Fig.12 Sensitivity test results for multiplex PCR
M, DNA marker DL2000; 1, Double PCR for S. agalactiae and S. aureus with dilution gradient of 10-1; 2, Double PCR for S. agalactiae and S. aureus with dilution gradient of 10-2; 3, Double PCR for S .agalactiae and S .aureus with dilution gradient of 10-3; 4, Double PCR for S. agalactiae and P. aeruginosa with dilution gradient of 10-1; 5, Double PCR for S. agalactiae and P. aeruginosa with dilution gradient of 10-2; 6, Double PCR for S. agalactiae and P. aeruginosa with dilution gradient of 10-3; 7, Double PCR for P. aeruginosa and S .aureus with dilution gradient of 10-1; 8, Double PCR for P. aeruginosa and S. aureus with dilution gradient of 10-2; 9, Double PCR for P. aeruginosa and S. aureus with dilution gradient of 10-3; 10, Multiplex PCR for S. agalactiae, S. aureus and P. aeruginosa with dilution gradient of 10-1; 11, Multiplex PCR for S. agalactiae, S. aureus and P. aeruginosa with dilution gradient of 10-2; 12, S. agalactiae, S. aureus and P. aeruginosa with dilution gradient of 10-3; 13-16, Negative control.

2.4 三重PCR重复性试验结果

三重PCR重复试验5次, 结果具有良好的重复性(图13)。

图13 三重PCR重复试验结果
M, DNA分子量标准DL2000; 1~5, 无乳链球菌与金黄色葡萄球菌与绿脓杆菌; 6, 阴性对照。
Fig.13 Repeat test results for triple PCR
M, DNA marker DL2000; 1-5, S. agalactiae, S. aureus and P. aeruginosa; 6, Negative control.

3 讨论

奶牛乳房炎是目前尚未彻底解决的奶牛常见和多发的疾病之一, 是奶牛乳腺受到蚊虫叮咬、物理刺激、病原微生物等环境刺激时, 产生的一系列不同程度的炎症反应[13]。根据是否出现明显临床症状, 将其分为临床乳房炎和隐性乳房炎, 其中隐性乳房炎发病率最高, 占牛群无明显临床乳房炎症状的奶牛的20%~50%, 给奶牛场造成极为严重的经济损失[14]。引起奶牛隐性乳房炎的病原较多, 临床上可在隐性乳房炎奶牛体内同时分离到多种微生物病原, 如细菌、支原体、真菌、病毒等。已有文献研究表明, 较常见的隐性乳房炎病原有23种, 其中细菌占14种, 霉形体2种, 真菌与病毒各7种[15]。本实验着重通过构建细菌检测方法分析隐性乳房炎的发病情况。目前, 从致病菌的传染性、普遍性及危害程度等角度来看, 导致奶牛乳房炎最重要的致病菌主要为金黄色葡萄球菌、无乳链球菌和绿脓杆菌[16, 17]

无乳链球菌亦称B群链球菌, 是一种专性乳腺寄生的具有高度传染性的致病菌, 多发于隐性乳房炎, 也可造成乳腺组织的纤维化[18], 还可引起新生儿败血症、肺炎和脑膜炎, 奶牛乳腺炎及鱼类脑膜炎[19], 是一种人兽共患病的病原菌。无乳链球菌的致病性与其产生的多种毒力因子有关, 已报道的有纤维蛋白原蛋白、菌毛蛋白、β 溶血素和脂磷壁酸等[20, 21]。在奶牛乳房炎中, 乳腺组织发生损伤, 为了修复损伤和改造炎性渗出物, 奶牛机体成纤维细胞转化为肌纤维母细胞, 分泌细胞外基质, 造成乳腺组织的纤维化。金黄色葡萄球菌属于传染性致病菌, 是引起奶牛隐性乳房炎最主要的病原微生物之一, 它不仅能逃逸宿主牛的天然防御系统, 还能摧毁宿主的免疫系统[22, 23], 常由乳头管侵入, 寄居于乳头管后再向乳腺组织内部蔓延, 造成急性乳房炎或慢性乳房炎; 除降低产奶量外, 还会导致乳区纤维化和小胳肿, 造成永久性实质病变[24]。金黄色葡萄球菌也是最易产生抗性菌株的病原菌之一, 它通过产生青霉素酶、L-型缺失细胞壁变种株等机制, 使其对抗生素耐药性大大增强, 临床治疗日渐困难[25]。绿脓杆菌为假单胞菌属条件性致病菌, 该菌广泛存在于自然界的水、土壤, 空气及动物的肠道和皮肤中。其代谢产物中有一种毒力很强的外毒素A, 是一种致死性外毒素。外毒素A可用福尔马林脱毒成为类毒素, 使其毒力减弱, 有防治绿脓杆菌感染的作用[26]。另外还有一种溶血毒素为磷脂酶C, 它能给入侵的细菌提供营养, 增加绿脓杆菌的毒力[27]。常常是因为奶牛乳房炎其他病原菌感染而引起的继发感染, 绿脓杆菌引起的乳房炎常为混合感染。由绿脓杆菌引起的隐性乳房炎往往会在很短的时间内转变成临床型乳房炎, 严重的会导致奶牛直接淘汰[28]

无乳链球菌16S rRNA基因具有高度的保守性和特异性并且该基因序列足够长, 金黄色葡萄球菌NUC基因具有热稳定性是检测金黄色葡萄球菌的重要标志[29], 绿脓杆菌ETA基因是编码外毒素的重要基因, 是绿脓杆菌标志性基因。因此本研究根据无乳链球菌16S rRNA基因、金黄色葡萄球菌NUC基因、绿脓杆菌ETA基因参考文献设计出3对特异性引物。单一PCR灵敏性试验结果表示, 无乳链球菌最低检出限是DNA浓度为6.68× 10-2 ng· μ L-1, 对应菌液浓度为8× 104 CFU· mL-1; 金黄色葡萄球菌最低检出限为DNA浓度5.97× 10-2 ng· μ L-1, 对应菌液浓度为4× 104 CFU· mL-1; 绿脓杆菌最低检出限为DNA浓度5× 10-3 ng· μ L-1, 对应菌液浓度为1.5× 105 CFU· mL-1。多重PCR灵敏性试验结果显示, 无乳链球菌与金黄色葡萄球菌双重PCR在稀释度10-2处能检出基因条带; 无乳链球菌与绿脓杆菌双重PCR在稀释度10-3处能检出基因条带; 绿脓杆菌与金黄色葡萄球菌双重PCR在稀释度10-2处能检出基因条带; 无乳链球菌与绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌的多重PCR在稀释度10-3处能检出基因条带。因此, 无论是多重PCR, 还是单重PCR, 在稀释度为10-2以下均能检测出基因条带, 对应的菌液浓度范围为1.5× 106 CFU· mL-1以上均能检测出基因条带。单一PCR与多重PCR特异性结果显示, 3种特异性引物与16S rRNA通用引物之间分别具有较高的特异性, 3种特异性引物扩增条带与GenBank上和细菌基因序列同源性为99%。三重PCR试验结果表明, 具有良好的重复性。综上所述, 本实验建立的多重PCR方法具有快速、简便、特异性强、灵敏度高的特征, 可有效用于奶牛隐性乳房炎中无乳链球菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌的检测。

The authors have declared that no competing interests exist.

参考文献
[1] 阚威, 王华, 马友记, . 牛源性无乳链球菌分离鉴定及 cfb基因的克隆和真核表达载体的构建[J]. 华北农学报, 2014, 29(5): 39-44.
KAN W, WANG H, MA Y J, et al. Construction of eukaryotic expression vector of cfb gene from bovine Streptococcus agalactiaee[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2014, 29(5): 39-44. (in Chinese with English abstract) [本文引用:2]
[2] 王剑, 肖小东, 耿建虎, . 奶牛临床型乳房炎的主要发病原因及防治措施[J]. 当代畜牧, 2017(6): 21-22.
WANG J, XIAO X D, GENG J H, et al. The main causes and prevention measures of clinical mastitis in dairy cows[J]. Contemporary Animal Husband ry, 2017(6): 21-22. (in Chinese) [本文引用:1]
[3] GAO G S, GAO G P, LI Z B, et al. The investigation of main pathogens causing dairy cattle recessive mastitis in Eastern Hebei[J]. Animal Husband ry and Feed Science, 2013(4): 198-200. [本文引用:1]
[4] 刘鸽, 张培生, 于会举, . 用测SCC法调查石河子某奶牛场隐性乳房炎的发病情况[J]. 中国乳业, 2017(1): 54-57.
LIU G, ZHANG P S, YU H J, et al. Investigation on incidence mastitis of a dairy farm in Shihezi by SCC method[J]. China Dairy, 2017(1): 54-57. (in Chinese) [本文引用:1]
[5] 曲家华, 周庆民. 奶牛隐性乳房炎的几种检测方法[J]. 养殖技术顾问, 2012(10): 155.
QU J H, ZHOU Q M. Several methods for detection of recessive mastitis in dairy cows[J]. Technical Advisor for Animal Husband ry, 2012(10): 155. (in Chinese) [本文引用:1]
[6] CHAMBERLAIN J S, GIBBS R A, RANIER J E, et al. Deletion screening of the Duchenne muscular dystrophy locus via multiple DNA amplification[J]. Nucleic Acids Research, 1988, 16(23): 11141-11156. [本文引用:1]
[7] 覃芳芸, 熊毅, 盛宇明, . 猪链球菌2型多重PCR检测方法的建立及应用[J]. 畜牧与兽医, 2007, 39(9): 4-6.
QIN F Y, XIONG Y, SHENG Y M, et al. Establishment and preliminary application of a multiplex PCR for rapid detection of Streptococcus suis type 2[J]. Animal Husband ry & Veterinary Medicine, 2007, 39(9): 4-6. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[8] 马保臣, 秦卓明, 蔡玉梅, . 多重PCR检测奶牛乳腺炎金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、停乳链球菌和酵母菌方法的建立与应用[J]. 畜牧兽医学报, 2006, 37(11): 1202-1208.
MA B C, QIN Z M, CAI Y M, et al. Development of a multiplex PCR for simultaneous detection of Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae, Streptococcus dysgalactiae and yeasts in Bovine mastitis milk samples[J]. Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica, 2006, 37(11): 1202-1208. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[9] 刘玉梅, 古丽扎尔·阿不都纳斯尔, 丁剑冰, 等. 环介导等温扩增与实时荧光定量PCR检测布鲁氏菌的比较[J]. 中国病原生物学杂志, 2016, 11(12): 1070-1073.
LIU Y M, GULIZHAER A, DING J B, et al. Comparison of the detection of Brucella by loop-mediated isothermal amplification and real-time PCR[J]. Journal of Pathogen Biology, 2016, 11(12): 1070-1073. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[10] PHUEKTES P, MANSELL P D, BROWNING G F. Multiplex polymerase chain reaction assay for simultaneous detection of Staphylococcus aureus and streptococcal causes of bovine mastitis[J]. Journal of Dairy Science, 2001, 84(5): 1140-1148. [本文引用:1]
[11] 王鹏飞. 实验动物金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌和肺支原体多重PCR检测方法的建立与初步应用[D]. 石家庄: 河北医科大学, 2016.
WANG P F. The establishment and preliminary application of multiple PCR for detecting Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, and Mycoplasma Pulmonis in laboratory animals[D]. Shijiazhuang: Hebei Medical University, 2016. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[12] WANG W, XI H, HUANG M, et al. Performance of mass spectrometric identification of bacteria and yeasts routinely isolated in a clinical microbiology laboratory using MALDI-TOF MS[J]. Journal of Thoracic Disease, 2014, 6(5): 524-533. [本文引用:1]
[13] GUNAWARDANA S, THILAKARATHNE D, ABEGUNAWARDANA I S, et al. Risk factors for bovine mastitis in the Central Province of Sri Lanka[J]. Tropical Animal Health & Production, 2014, 46(7): 1105-1112. [本文引用:1]
[14] WANG X, WANG X, WANG Y, et al. Antimicrobial resistance and toxin gene profiles of Staphylococcus aureus strains from Holstein milk[J]. Letters in Applied Microbiology, 2014, 58(6): 527-534. [本文引用:1]
[15] 解绍栋, 唐金茹. 奶牛乳房炎的预防和治疗[J]. 山东畜牧兽医, 2012(12): 97.
XIE S D, TANG J R. Dairy cow mastitis prevention and treatment[J]. Shand ong Journal of Animal Science and Veterinary Medicine, 2012(12): 97. (in Chinese) [本文引用:1]
[16] 丁天翊, 潘阳阳, 何翃闳, . 快速检测奶牛乳房炎四种病原菌的多重PCR方法的建立及应用[J]. 中国兽医科学, 2018, 48(1): 19-26.
DING T Y, PAN Y Y, HE H H, et al. Development and applications of a multiplex-PCR for quick detection of four pathogens resulting in bovine mastitis[J]. Chinese Veterinary Science, 2018, 48(1): 19-26. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[17] 李栋梁, 寇亚楠, 宋月, . 利用16S rDNA检测奶牛乳房炎5种病原菌PCR方法的建立及应用[J]. 河南农业科学, 2014, 43(6): 132-136.
LI D L, KOU Y N, SONG Y, et al. Detection of five bacterial species in bovine mastitis by PCR based on 16S rDNA sequence[J]. Journal of Henan Agricultural Sciences, 2014, 43(6): 132-136. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[18] 赵弥, 丁玉林, 毕艳楠, . 无乳链球菌对体外培养的奶牛乳腺成纤维细胞瘦素及其受体表达的影响[J]. 中国预防兽医学报, 2017, 39(9): 750-754.
ZHAO M, DING Y L, BI Y N, et al. Effects of Streptococcus agalactiae on the expression of leptin and OB-Rb in bovine mammary fibroblasts cultured in vitro[J]. Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine, 2017, 39(9): 750-754. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[19] 罗素, 马可, 王兆飞, . 无乳链球菌透明质酸酶的可溶性表达及其对小鼠的致病作用[J]. 中国兽医科学, 2016(8): 997-1002.
LUO S, MA K, WANG Z F, et al. Prokaryotic expression of hyaluronidase from Streptococcus agalactiae and its pathogenicity in mice[J]. Chinese Veterinary Science, 2016(8): 997-1002. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[20] MAISEY H C, HENSLER M, NIZET V, et al. Group B Streptococcal pilus proteins contribute to adherence to and invasion of brain microvascular endothelial cells[J]. Journal of Bacteriology, 2007, 189(4): 1464-1467. [本文引用:1]
[21] FAUST S N, PATHAN N, LEVIN M. Bacterial meningitis and brain abscess[J]. Medicine, 2009, 33(4): 55-60. [本文引用:1]
[22] DOS SANTOS F F, REIS D R, et al. Presence of mecA-positive multidrug-resistant Staphylococcus epidermidis in bovine milk samples in Brazil[J]. Journal of Dairy Science, 2016, 99(2): 1374-1382. [本文引用:1]
[23] XU J, TENG D, JIANG F, et al. Mycoplasma gallisepticum MGA_0676 is a membrane-associated cytotoxic nuclease with a staphylococcal nuclease region essential for nuclear translocation and apoptosis induction in chicken cells[J]. Applied Microbiology & Biotechnology, 2015, 99(4): 1859-1871. [本文引用:1]
[24] 叶芬, 曹杰, 魏学良. 奶牛乳房炎防治研究进展[J]. 中国牛业科学, 2007, 33(5): 53-55.
YE F, CAO J, WEI X L. Research advance of prevention and treatment of mastitis in dairy cattle[J]. China Cattle Science, 2007, 33(5): 53-55. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[25] MEIRI-BENDEK I, LIPKIN E, FRIEDMANN A, et al. A PCR-based method for the detection of Streptococcus agalactiae in milk[J]. Journal of Dairy Science, 2002, 85(7): 1717-1723. [本文引用:1]
[26] VOULHOUX R, TAUPIAC M P, CZJZEK M, et al. Influence of deletions within domain II of exotoxin A on its extracellular secretion from Pseudomonas aeruginosa[J]. Journal of Bacteriology, 2000, 182(14): 4051-4058. [本文引用:1]
[27] 刘祥. 重组铜绿假单胞菌外毒素A的原核表达和多克隆抗体制备及免疫保护功能分析[J]. 湖南农业大学学报(自然科学版), 2016, 42(1): 33-38.
LIU X. Prokaryotic expression, polyclonal antibody preparation and immunoprotection potential of exotoxin A from recombinant Pseudomonas aeruginosa[J]. Journal of Hunan Agricultural University( Natural Science Edition), 2016, 42(1): 33-38. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[28] 韩青松, 简永利, 涂宜强, . 绿脓杆菌研究进展[J]. 畜牧与饲料科学, 2012, 33(1): 122-124.
HAN Q S, JIAN Y L, TU Y Q, et al. Research advances on Pseudomonas aeruginosa[J]. Animal Husband ry and Feed Science, 2012, 33(1): 122-124. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]
[29] 唐俊妮. 金黄色葡萄球菌耐热核酸酶相关基因的功能与特征分析[D]. 武汉: 华中农业大学, 2007.
TANG J N. Characterization and function analysis of the thermostable nuclease genes in Staphylococcus aureus[D]. Wuhan: Huazhong Agricultural University, 2007. (in Chinese with English abstract) [本文引用:1]