一种基于模板DNA的PCR扩增难易预测方法

›› 2012, Vol. 24 ›› Issue (4): 0-720.

• 论文 •

一种基于模板DNA的PCR扩增难易预测方法

范秀静,李楠,李春

渤海大学数理学院, 辽宁锦州 121000

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2012-07-25 发布日期:2012-07-25

A predictive method for polymerase chain reactions based on the template DNA

FAN Xiujing;LI Nan;LI Chun

College of Mathematics and Physics, Bohai University, Jinzhou 121000, China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2012-07-25 Published:2012-07-25

摘要/Abstract

摘要： 借助赋予四种碱基A,G,C,T四个三维空间中的点(0,0,1),(0,1,0),(-1,-1,0),(1,0,0),将一条DNA序列转化为一个二十四维向量。在此基础上利用Fisher线性判别法对人类基因组中189条基因片段进行PCR扩增难易预测,识别率达到了90%。

关键词: 模板DNA, 24维向量, 聚合酶链式反应(PCR)

Abstract: By means of assigning (0,0,1),(0,1,0),(-1,-1,0),(1,0,0) to the four bases A, G, C and T, a DNA sequence is transformed into a 24dimensional vector. Based on this and the Fisher linear discriminant algorithm, we proposed a computational method to predict success for PCR. Our report is based on 189 amplicons randomly selected from human exons, and our method achieves an accuracy of 90%.

Key words: template DNA, 24dimensional vector, polymerase chain reactions (PCR)

范秀静;李楠;李春. 一种基于模板DNA的PCR扩增难易预测方法[J]. , 2012, 24(4): 0-720.

FAN Xiujing;LI Nan;LI Chun. A predictive method for polymerase chain reactions based on the template DNA[J]. , 2012, 24(4): 0-720.

[1]	刘永安1，2，潘彬荣1，2，岳高红1，2，梅喜雪2，许立奎1，2，*，张宗宸1，2，周志辉1，2. 小麦优质亚基和抗白粉病Pm4a基因聚合体的PCR鉴定[J]. 浙江农业学报, 2016, 28(4): 545-.
[2]	林星宇1，2，胡凌1，王印1，2，*，杨泽晓1，姚学萍1，肖璐1，任梅渗1，曾相杰1. 猪源多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及荚膜血清分型[J]. 浙江农业学报, 2016, 28(4): 558-.

一种基于模板DNA的PCR扩增难易预测方法

A predictive method for polymerase chain reactions based on the template DNA

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 2

编辑推荐

Metrics

本文评价