SgP5CS基因克隆和生物信息学分析
- （1. 浙江省农业科学院 作物与核技术利用研究所，浙江 杭州 310021；2. 萧山区种子管理站，浙江 杭州 311201）
Molecular cloning and bioinformatics analysis of SgP5CS gene in Suaeda glauca
- （1. Institute of Crops and Nuclear Technology Utilization， Zhejiang Academy of Agricultural Science， Hangzhou 310021， China；2. Seed Management Station of Xiaoshan District， Hangzhou 311201， China）
摘要： 利用同源克隆的方法，获得了碱蓬P5CS基因全长ORF，命名为SgP5CS。SgP5CS ORF全长2 151 bp，生物信息学软件预测其编码716个氨基酸组成的多肽，相对分子量为77 431.8 u， 等电点为5.71，为稳定的亲水性蛋白，无跨膜结构域。ClustalX多重序列比对发现SgP5CS编码的氨基酸序列与盐角草P5CS相似性为93%，与盐角草P5CS的亲缘关系最近，其次是甜菜。脯氨酸是生物体内重要的渗透调节剂，而Δ1吡咯啉5羧酸合成酶则是植物合成脯氨酸的关键酶之一，SgP5CS的克隆将为进一步的功能分析鉴定基础。
