利用SSR技术研究浙江省稻瘟病菌群体的遗传多样性

浙江农业学报

利用SSR技术研究浙江省稻瘟病菌群体的遗传多样性

（1 浙江师范大学化学与生命科学学院，浙江金华 321004；2 浙江省植物有害生物防控重点实验室，省部共建国家重点实验室培育基地，浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所，浙江杭州 310021）

出版日期:2015-10-25 发布日期:2015-10-20

Analysis of genetic diversity of Magnaporthe oryzae isolates from Zhejiang Province based on SSR markers#br#

（1 College of Chemistry and Life Science， Zhejiang Normal University， Jinhua 321004， China; 2 State Key Laboratory Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control， Institute of Plant Protection and Microbiology， Zhejiang Academy of Agricultural Sciences， Hangzhou 310021， China）

Online:2015-10-25 Published:2015-10-20

摘要/Abstract

摘要： 为研究浙江省稻瘟病菌群体的遗传多样性，利用分布于稻瘟病菌7条染色体上的28对SSR引物，对浙江省11个城市1978至2011年11个城市的稻瘟病菌的遗传结构多样性进行了分析。结果表明，28对SSR引物共扩增出171个等位基因，每对引物可扩出2～24个等位基因，平均多样性指数0534，平均多态性信息含量为0494。分离于不同地理位置的稻瘟病菌株的多样性较高，其中丽水和杭州的遗传多样性最高，舟山的遗传多样性最低。分离于不同年份的稻瘟病菌的遗传结构差异较大，1990年的遗传多样最高，1978年的遗传多样性最低。分离于不同水稻类型的稻瘟病菌的遗传多样性较高，部分分离于籼稻和粳稻的稻瘟病菌的遗传结构相似甚至相同，分离于籼稻的稻瘟病菌的遗传多样性高于分离于粳稻的稻瘟病菌。

关键词: 稻瘟病菌, SSR, 遗传结构, 多样性

Abstract: Twenty\|eight pairs of SSR primers that distributed on 7 chromosomes of Magnaporthe oryzae were used to study the genetic diversity of M.oryzae isolates from Zhejiang Province. M.oryzae strains isolated from 11 different areas in Zhejiang Province， from 1978 to 2011 were used as materials. Results showed that the total amplified alleles were 171， the amplified alleles of each primer pairs was 2 to 24， the average diversity index was 0534 and the average polymorphism information content was 0494. The genetic structure of M.oryzae strains isolated from different areas was different， Lishui and Hangzhou populations had the highest genetic diversity and Zhoushan population had the lowest genetic diversity. Genetic diversities of M.oryzae isolates from different years were different， the 1990 population had the highest genetic diversity, while the 1978 population had the lowest genetic diversity. The genetic structure of M.oryzae isolated from different rice types was different， a part of strains isolated from indica and japonica had the similarity genetic structure, and the strains isolated from indica rice had the higher genetic diversity than those isolated from japonica rice.

Key words: Magnaporthe oryzae, SSR, genetic structure, diversity

谢晶晶1，2，姜华2，毛雪琴2，柴荣耀2，邱海萍2，张震2，王艳丽2，王教瑜2，杜新法2，孙国昌2，*. 利用SSR技术研究浙江省稻瘟病菌群体的遗传多样性[J]. 浙江农业学报.

[1]	赵秀平, 王双, 闫星伊, 段强, 张帅, 陈永胜, 李国瑞. 稻瘟病菌MGG-01005的表达纯化与生物信息学分析[J]. 浙江农业学报, 2021, 33(3): 470-478.
[2]	洪霞, 赵永彬, 屈为栋, 陈银龙, 邱莉萍, 王娇阳. 基于表型性状与简单重复序列标记的浙江省芋种质资源遗传多样性比较[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(9): 1544-1554.
[3]	郭勤卫, 张婷, 刘慧琴, 章心惠, 李朝森, 项小敏, 赵东风, 万红建. 应用ISSR分子标记评价我国丝瓜种质资源遗传多样性[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(4): 616-623.
[4]	赵星凯, 石海春, 余学杰, 杨殊, 赵长云, 夏伟, 柯永培. 十三份玉米新自交系的育种潜势分析[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(12): 2119-2127.
[5]	胡倩文, 徐延浩, 王容, 张文英, 华为, 吕超. 大麦4个穗部性状的关联分析[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(11): 1941-1953.
[6]	岳高红, 潘彬荣, 刘永安, 梅喜雪, 许立奎, 张宗宸, 周志辉. 利用SSR分析浙南地区甜玉米自交系的遗传多样性[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(7): 1029-1036.
[7]	赵文杰, 徐薇, 张景龙, 程爽, 郑甲成, 刘言龙, 殷世霞, 李杰勤, 詹秋文. 甜高粱生物学性状与SSR分子标记遗传多样性[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(12): 1945-1954.
[8]	冯晓晓, 李海娇, 李玲, 王教瑜, 林福呈, 卢建平. GCK家族蛋白激酶MoSOK1调控稻瘟病菌的生长发育与致病性[J]. 浙江农业学报, 2018, 30(6): 999-1007.
[9]	王向东, 马艳芝, 客绍英. 11种荆芥种质资源ISSR分析[J]. 浙江农业学报, 2018, 30(4): 614-621.
[10]	王庆军, 马丽, 郝兆祥, 罗华, 毕润霞, 赵丽娜, 侯乐峰. 观赏石榴种质资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 浙江农业学报, 2018, 30(2): 236-241.
[11]	崔书建, 王教瑜, 姜华, 梁建生. 稻瘟病菌分泌蛋白组学研究[J]. 浙江农业学报, 2018, 30(11): 1899-1906.
[12]	郭正兵, 韩柏明, 郭强. SSR荧光标记毛细管电泳法分析30份无花果品种的遗传多样性[J]. 浙江农业学报, 2017, 29(9): 1482-1488.
[13]	张志仙, 何道根, 朱长志, 檀国印, 高旭. 青花菜种质资源遗传多样性的SSR分析[J]. 浙江农业学报, 2017, 29(2): 228-235.
[14]	潘建义1,成浩2，*，王丽鸳2，马军辉1. 基于ISSR分子标记的茶树品系丽早香遗传特性分析[J]. 浙江农业学报, 2016, 28(6): 999-.
[15]	张鹏1，2，蔡一凡3，王铁杆1，2，*，钟晨辉4，谢起浪1，2，陈少波1，2，王宁1，2. 浙江沿海不同地理群体铜藻Sargassum horneri的AFLP分析[J]. 浙江农业学报, 2015, 27(9): 1586-.