部分茶竿竹亚属竹种亲缘关系的ITS序列分析

浙江农业学报

部分茶竿竹亚属竹种亲缘关系的ITS序列分析

（1. 国家林业局竹子研究开发中心，浙江杭州 310012；2. 浙江省竹子高效加工重点实验室，浙江杭州 310012）

出版日期:2016-02-25 发布日期:2016-03-10

Analysis on genetic relationship of some Chagan\|bamboo species by using ITS region sequence

（1. China National Bamboo Research Center， Hangzhou 310012， China; 2. Key Laboratory of High Efficient Processing of Bamboo of Zhejiang Province， Hangzhou 310012， China）

Online:2016-02-25 Published:2016-03-10

摘要/Abstract

摘要： 为了探讨怀集县铁厘茶竿竹和白水茶竿竹与其他茶竿竹亚属竹种之间在分子水平上的差异以及它们的分类地位，对包括铁厘茶竿竹和白水茶竿竹在内的9个茶竿竹亚属竹种的核糖体基因（nrDNA）的内转录间隔区（ITS）序列进行分析，并构建系统进化树。结果表明，所有供试材料ITS全长在559～648 bp，(G+C)含量变化范围为46.02%～57.65%，其中铁厘茶竿竹和白水茶竿竹ITS全长分别为559 bp和614 bp，(G+C)含量分别为55.64%和57.65%。ITS序列构建的系统进化树显示：正种茶竿竹及其变种聚为一个大支，其中铁厘茶竿竹和白水茶竿竹聚在一起。以上结果佐证了铁厘茶竿竹和白水茶竿竹是正种茶竿竹的2个变种。

关键词: 正种茶竿竹, ITS, 系统进化树

Abstract: The molecular differences among Pseudosasa amabilis var. ferrea， Pseudosasa amabilis var. peshuiensis and other Chagan\|bamboo species were identified by analyzing internal transcribed spacer sequence in nrDNA of P.amabilis var. ferrea， P.amabilis var. peshuiensis and other 7 Chagan\|bamboo species. and the phylogenetic tree was established to clarify their taxonomic status. The results showed that ITS length of all tested species ranged from 559 to 648 bp， and their (G+C) content ranged from 46.02% to 57.65%. ITS length of P.amabilis var. ferrea and P.amabilis var. peshuiensis was 559 bp and 614 bp, respectively. Their (G+C) content was 55.64% and 57.65%, respectively. The established phylogenetic tree showed that P.amabilis and its varieties were clustered in one big group， in which P.amabilis var. ferrea and P.amabilis var. peshuiensis were clustered into one small group. The above results indicated that P.amabilis var. ferrea and P.amabilis var. peshuiensis were two variants of Pseudosasa amabilis.

Key words: Pseudosasa amabilis, ITS, phylogenetic tree

钟浩1，2，高贵宾1，2，吴良如1，2，*. 部分茶竿竹亚属竹种亲缘关系的ITS序列分析[J]. 浙江农业学报.

ZHONG Hao1，2， GAO Gui\|bin1，2， WU Liang\|ru1，2，*. Analysis on genetic relationship of some Chagan\|bamboo species by using ITS region sequence[J]. .

[1]	陈文强, 汪小福, 陈笑芸, 彭城, 徐俊锋, 蔡健. 基于ITS2和SNP技术鉴定浙江铁皮石斛的初步研究[J]. 浙江农业学报, 2021, 33(1): 69-76.
[2]	刘凯, 冯晓宇, 马恒甲, 谢楠. 钱塘江三角鲂线粒体基因组测序及其结构特征分析[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(9): 1591-1608.
[3]	陈乾丽, 汪汉成, 梁永进, 蔡刘体, 黄宇, 周浩, 李忠, 韩洁. 烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落结构分析[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(6): 1019-1028.
[4]	马杰, 郑好, 周平, 陈春艳, 吴瑞, 马维, 宋雷, 孙勃. 马铃薯油菜素内酯信号激酶基因StBSKs的克隆与序列分析[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(8): 1224-1230.
[5]	巫伟峰, 陈孝丑, 陈发兴, 陈春, 张毅智. 基于ITS2序列探讨兰属的DNA条形码鉴定和系统发育关系[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(8): 1295-1304.
[6]	王伟科, 宋吉玲, 巫优良, 闫静, 陆娜, 袁卫东, 陈观平. 药用真菌桑黄分子鉴定及遗传多样性分析[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(2): 307-314.
[7]	周会明, 张焱珍, 柴红梅, 杨荣情, 谭莹, 张萍萍, 白玉英, 赵一莲, 金玉洁. 一株临沧野生黄鸡?的鉴定与生长条件研究[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(10): 1655-1662.
[8]	曹钰莹, 李威, 钟志军, 肖洁, 弓超, 王承东, 李才武, 杨海迪, 黄祥明, 吴孔菊, 彭广能. 动物园圈养大熊猫毕氏肠微孢子虫分子流行病学调查[J]. 浙江农业学报, 2018, 30(7): 1132-1136.
[9]	钟锐, 姜尧章, 马晓平, 左之才, 黄小丽, 邓俊良, 沈留红, 余树民. 肉牛源毛孢子菌Trichosporon loubieri的分离鉴定与药敏试验[J]. 浙江农业学报, 2018, 30(1): 26-35.
[10]	张文泉, 罗国涛, 余洋, 闫伟. 樟子松外生菌根形态类型及分子鉴定[J]. 浙江农业学报, 2017, 29(10): 1678-1685.
[11]	原小雅1，2,，刘立波2，3,，郑麦青2，刘冉冉2，李庆贺2，王巧2,崔焕先2，文杰2，. 利用MHC B-L基因外显子2分析部分中国地方鸡种的遗传多态性[J]. 浙江农业学报, 2016, 28(7): 1121-.
[12]	邹莉，杨苑艺，孙婷婷，王世新，崔嵘，李晶莹. 野生花脸香蘑的分离纯化及ITS序列鉴定[J]. 浙江农业学报, 2016, 28(2): 264-.
[13]	王丁晶1，马家海1，*，杜晶1，谢恩义2，施建华3. 礁膜Monostroma nitidum的形态学观察和分子鉴定[J]. 浙江农业学报, 2015, 27(9): 1593-.
[14]	汪巧英，张雪，左诗璇，郑梦如，张梦琼，章燕如，蒋明*. 万代兰属植物rDNA ITS序列的克隆与分析[J]. 浙江农业学报, 2015, 27(8): 1362-.
[15]	章旭日，潘杰，Tukayo Meks，余良，方文珍，罗大民*. 福建茶区小贯小绿叶蝉rDNA序列分析及形态再描述[J]. 浙江农业学报, 2015, 27(10): 1773-.