三十份菊芋资源亲缘关系的SRAP分析

浙江农业学报

三十份菊芋资源亲缘关系的SRAP分析

（青海省农林科学院菊芋研发中心，青海省蔬菜遗传与生理重点实验室，青海西宁 810016）

出版日期:2014-09-25 发布日期:2014-10-11

Analysis of genetic relationship of 30 Jerusalem artichoke germplasm resources by SRAP markers

（Research and Development Center of the Jerusalem artichoke，Qinghai Laboratory of Vegetable Genetics and Physiology， Qinghai Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Xining 810016，China）

Online:2014-09-25 Published:2014-10-11

摘要/Abstract

摘要： 利用SRAP分子标记技术对30份菊芋资源进行了基因组多态性分析。用22对扩增稳定且清晰的具有多态性 DNA条带的引物组合，进行菊芋的SRAP\|PCR扩增。共扩增出160条条带，其中多态性条带114条，多态性比率为71%，表明菊芋资源在DNA水平上存在广泛差异。利用NTSYS软件统计分析出资源间遗传距离在004～042之间。应用UPGMA得出聚类结果，将30份菊芋资源划分为2大类群，第2大类群分为6个亚类群。聚类结果与传统的形态学分类略有不同，可结合两种方法为菊芋资源亲缘关系的研究提供理论基础。

关键词: 菊芋, SRAP, 亲缘关系, 聚类分析

Abstract: Genetic diversity was analyzed in 30 accessions of Jerusalem artichoke using SRAP markers. 22 primer combinations were used for SRAP\|PCR amplification of Jerusalem artichoke. 160 DNA fragments were amplified from 30 samples and 114 fragments were polymorphic （percentage of polymorphic bands was 71%）， indicating that there were wide differences at DNA level among Jerusalem artichoke resource. The genetic distance indexes of 30 cultivars based on the SRAP data varied from 004 to 042. It suggested that the genetic diversity among resources of Jerusalem artichoke was high. Cluster analysis with UPGMA method showed that the 30 resources tested in this study could be divided into two groups. The second group could be divided into six sub groups. The clustering results were slightly different with traditional morphological classification. The above two methods could be combined to provide a theoretical basis for the study on the Jerusalem artichoke resource relationship.

Key words: Jerusalem artichoke（Helianthus tuberosus L.）, SRAP, genetic relationship, cluster analysis

马胜超，韩睿，任鹏鸿，杨世鹏，李莉*. 三十份菊芋资源亲缘关系的SRAP分析 [J]. 浙江农业学报.

MA Sheng\|chao，HAN Rui，REN Peng\|hong，YANG Shi\|peng，LI Li*. Analysis of genetic relationship of 30 Jerusalem artichoke germplasm resources by SRAP markers [J]. .

[1]	许卫猛, 徐妍, 陈国立. 基于多种分析方法的糯玉米品质综合评价[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(9): 1840-1848.
[2]	刘思彤, 侯宇, 潘家荃, 周桦楠, 崔亮, 万博, 于涛. 甘薯对低温胁迫的生理响应及耐寒性评价[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(4): 767-778.
[3]	郭赛赛, 聂智星, 傅鸿妃, 王同林, 邵志勇, 王宏, 郑积荣. 37份辣椒种质资源的表型性状及SRAP遗传多样性分析[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(2): 300-310.
[4]	董莉莉, 徐志浩, 严灿龙, 范小平, 金泽兰, 王忠华. 基于表型与分子标记对浙贝母不同育种群体的分子鉴定与亲缘关系研究[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(8): 1719-1730.
[5]	张海洋, 黄宣, 周薇, 向鑫, 马玉芳, 尹兆正. 基于SNP芯片的固原鸡遗传结构与保种效果分析[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(7): 1530-1536.
[6]	李亚东, 罗小波, 彭潇, 杨光乾, 金月月, 祖贵东, 田欢, 张万萍. 萝卜SNP和InDel分子标记开发及与表型性状关联分析[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(5): 1055-1066.
[7]	薛贤滨, 贾琼, 陈峥峰, 黎瑞源, 陈庆富, 石桃雄. 基于主成分分析的苦荞麦重组自交系农艺性状综合评价[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(4): 748-759.
[8]	吴倩, 汤紫依, 田盛野, 何海叶, 潘伟伟, 王军峰, 鲍洪华, 张慧娟, 蒋明. 基于SRAP分子标记的华顶杜鹃遗传多样性[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(1): 127-133.
[9]	冷益丰, 罗樊, 陈从顺, 丁鑫, 蔡光泽. 基于GBS测序的全基因组SNP揭示大凉山玉米地方品种资源的亲缘关系与遗传分化[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(1): 32-47.
[10]	娄茜棋, 梁燕. 五类不同果色番茄种质资源品质分析[J]. 浙江农业学报, 2023, 35(3): 582-589.
[11]	王如月, 罗莎莎, 甄紫怡, 吴嘉龙, 徐业勇, 孙雅丽, 胡晓静, 虎海防. 风味皇后杏李果实不同成熟度特性研究[J]. 浙江农业学报, 2023, 35(12): 2865-2877.
[12]	翟艺兰, 张楚磊, 楚爱香, 高俊鸽, 夏晴情, 卢志昌. 二十七种槭属植物表型多样性分析[J]. 浙江农业学报, 2023, 35(11): 2621-2635.
[13]	蒋瑞平, 赵辰晖, 李文杰, 安秋菊, 李佳伦, 周嘉裕, 李遂焰, 廖海. 豆科植物IPI基因密码子偏好性[J]. 浙江农业学报, 2022, 34(6): 1114-1123.
[14]	赵宇洪, 何文, 李根, 王强, 谢锐, 王燕, 陈清, 王小蓉. 四川地区琯溪蜜柚及其芽变品种的果实品质[J]. 浙江农业学报, 2022, 34(5): 995-1004.
[15]	裴芸, 徐秀红, 陆锦彪, 陈阿敏, 张万萍. 151份贵州地方樱桃番茄资源的遗传多样性分析[J]. 浙江农业学报, 2022, 34(2): 310-316.