植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的生物信息学分析

›› 2011, Vol. 23 ›› Issue (2): 0-208.

• 作物科学 •

植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的生物信息学分析

关晶晶1,2,陈锦清2,汪小福3,*

1浙江师范大学化学与生命科学学院, 浙江金华 321004；2浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所,浙江杭州 310021；3浙江省农业科学院农产品质量标准研究所,浙江杭州 310021

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-03-25 发布日期:2011-03-25

Bioinformatic analysis on bacterial\|type phosphoenolpyruate carboxylase in plants

GUAN Jing-jing;CHEN Jin-qing;WANG Xiao-fu;*

1College of Chemistry and Life Sciences, Zhejiang Normal University, Jinhua 321004, China; 2 Institute of Virology and Biotechnology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China; 3Institute of Agriculture Quality and Standard, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2011-03-25 Published:2011-03-25

摘要/Abstract

摘要： 采用生物信息学方法对GenBank中的拟南芥、油菜、大豆、花生和水稻等11种植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的核苷酸和氨基酸序列进行了比对分析,进而对其基因结构、系统进化、理化性质、亚细胞定位、疏水性、功能结构域及蛋白质三级结构等重要参数进行了预测和分析。

关键词: 植物, 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC), 生物信息学

Abstract: The nucleic acid sequence and amino acid sequence of phosphoenolpyruate carboxylase (PEPC) from eleven plants such as Arabidopsis thaliana, Brassica napus, Glycine max, Arachis hypogaea and Oryza sativa japonica, which were registered in GenBank, were analyzed and predicted by the tools of bioinformatics in the following aspects, mainly including the composition of nucleic acid sequence and amino acid sequence, physical and chemical characters, subcellular localization, hydrophobicity, structure functional domains, motifs search, tertiary structure of protein．

Key words: plant, phosphoenolpyruate carboxylase (PEPC), bioinformatics

关晶晶;陈锦清;汪小福;*. 植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的生物信息学分析[J]. , 2011, 23(2): 0-208.

GUAN Jing-jing;CHEN Jin-qing;WANG Xiao-fu;*. Bioinformatic analysis on bacterial\|type phosphoenolpyruate carboxylase in plants[J]. , 2011, 23(2): 0-208.

[1]	胡莹洁, 杜晨琪, 王鎏帆, 寿建昕, 王超, 徐梅, 严旭. 囊泡运输调控植物盐胁迫响应的研究进展[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(9): 2003-2011.
[2]	师阳阳, 吕丽霞, 脱登峰. 低温弱光胁迫下AMF和PGPR对紫罗兰生长及营养吸收的影响[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(8): 1694-1705.
[3]	陈敏, 张巧艳, 王夏君, 王顺利, 郑蔚然. 固相萃取-高效液相色谱法测定植物源性产品中的熊果苷[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(8): 1776-1784.
[4]	赵泓雨, 周宇杰, 李建忠, 郑涵, 毕继安, 余初浪, 周宇航, 侯凡, 戴彬凤, 钟列权, 严成其, 张海鹏, 杨勇, 陈剑平, 王成雨. 微塑料对植物影响的研究现状、未来展望与植物激素抵抗微塑料的分子生物学机制[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(7): 1595-1604.
[5]	狄延翠, 嵇泽琳, 王媛媛, 娄世浩, 张涛, 国志信, 申顺善, 朴凤植, 杜南山, 董晓星, 董韩. 番茄SlMYB52基因鉴定、亚细胞定位及表达分析[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(4): 808-819.
[6]	夏思, 房祥军, 吴伟杰, 刘瑞玲, 陈慧芝, 牛犇, 郜海燕. 发酵型杨梅果浆的制备及其功能风味品质研究[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(3): 667-678.
[7]	张美莹, 莫倩, 齐秀双, 佟宁宁, 孔凡, 刘政安, 吕长平, 彭丽平. 牡丹PoLPAT2基因的克隆及表达分析[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(2): 321-328.
[8]	崔博文, 张思懿, 王佳玲, 王竞红, 蔺吉祥, 杨青杰. 宽叶苔草WRKY家族成员生物信息学分析与耐旱基因挖掘[J]. 浙江农业学报, 2025, 37(10): 2087-2103.
[9]	白健, 罗来聪, 李爱新, 赖晓琴, 申展, 刘亮英, 郭圣茂, 张令. 不同生境入侵植物喜旱莲子草碳排放对氮磷输入的响应[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(9): 2070-2078.
[10]	展梦琪, 苏傲雪, 侯倩, 张皓宇, 姜欣蕊, 徐艳. 水稻对林丹的吸收累积与代谢组学研究[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(9): 2110-2121.
[11]	蒋文骏, 舒红锁, 陈正满, 任典挺, 杨党, 田荣江, 杜照奎. 秋茄KoWRKY43基因克隆、表达与生物信息学分析[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(8): 1832-1843.
[12]	傅志强, 刘祯, 马春花, 温梦玲, 奚如春. 生物炭及炭基肥对土壤质量与植物生长的影响[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(7): 1634-1645.
[13]	朱学慧, 谢辉, 韩守安, 王敏, 白世践, 马云龙, 王艳蒙, 麦斯乐, 潘明启, 张雯. 两种植物生长调节剂对无核白鸡心葡萄果实品质的影响[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(6): 1309-1319.
[14]	赵黎明, 王亚新, 蒋文鑫, 段绍彪, 沈雪峰, 郑殿峰, 冯乃杰. 植物生长调节剂对优质粳稻产量、品质与光合特性的影响[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(5): 1003-1014.
[15]	鲁子正钢, 朱立新, 季宏兵, 汪康. 鞘氨醇单胞菌修复土壤重金属污染研究进展[J]. 浙江农业学报, 2024, 36(5): 1208-1216.

植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的生物信息学分析

Bioinformatic analysis on bacterial\|type phosphoenolpyruate carboxylase in plants

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