植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的生物信息学分析

›› 2011, Vol. 23 ›› Issue (2): 0-208.

• 作物科学 •

植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的生物信息学分析

关晶晶1,2,陈锦清2,汪小福3,*

1浙江师范大学化学与生命科学学院, 浙江金华 321004；2浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所,浙江杭州 310021；3浙江省农业科学院农产品质量标准研究所,浙江杭州 310021

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-03-25 发布日期:2011-03-25

Bioinformatic analysis on bacterial\|type phosphoenolpyruate carboxylase in plants

GUAN Jing-jing;CHEN Jin-qing;WANG Xiao-fu;*

1College of Chemistry and Life Sciences, Zhejiang Normal University, Jinhua 321004, China; 2 Institute of Virology and Biotechnology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China; 3Institute of Agriculture Quality and Standard, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2011-03-25 Published:2011-03-25

摘要/Abstract

摘要： 采用生物信息学方法对GenBank中的拟南芥、油菜、大豆、花生和水稻等11种植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的核苷酸和氨基酸序列进行了比对分析,进而对其基因结构、系统进化、理化性质、亚细胞定位、疏水性、功能结构域及蛋白质三级结构等重要参数进行了预测和分析。

关键词: 植物, 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC), 生物信息学

Abstract: The nucleic acid sequence and amino acid sequence of phosphoenolpyruate carboxylase (PEPC) from eleven plants such as Arabidopsis thaliana, Brassica napus, Glycine max, Arachis hypogaea and Oryza sativa japonica, which were registered in GenBank, were analyzed and predicted by the tools of bioinformatics in the following aspects, mainly including the composition of nucleic acid sequence and amino acid sequence, physical and chemical characters, subcellular localization, hydrophobicity, structure functional domains, motifs search, tertiary structure of protein．

Key words: plant, phosphoenolpyruate carboxylase (PEPC), bioinformatics

关晶晶;陈锦清;汪小福;*. 植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的生物信息学分析[J]. , 2011, 23(2): 0-208.

GUAN Jing-jing;CHEN Jin-qing;WANG Xiao-fu;*. Bioinformatic analysis on bacterial\|type phosphoenolpyruate carboxylase in plants[J]. , 2011, 23(2): 0-208.

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植物细菌型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的生物信息学分析

Bioinformatic analysis on bacterial\|type phosphoenolpyruate carboxylase in plants

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