贵州茶树种质资源遗传多样性、群体结构和遗传分化研究

doi:10.3969/j.issn.1004-1524.2021.07.09

浙江农业学报 ›› 2021, Vol. 33 ›› Issue (7): 1234-1243.DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2021.07.09

贵州茶树种质资源遗传多样性、群体结构和遗传分化研究

安红卫(), 宋勤飞, 牛素贞^*()

贵州大学茶学院, 贵州贵阳 550025

收稿日期:2021-03-05 出版日期:2021-07-25 发布日期:2021-08-06
作者简介:*牛素贞,E-mail: niusuzhen@163.com
安红卫(1995—),女,贵州道真人,硕士研究生,主要从事茶树种质资源与遗传改良。E-mail: 2541669421@qq.com
通讯作者: 牛素贞
基金资助:
贵州省自然科学基金重点项目(黔科合基础〔2019〕1404 号);国家自然科学基金(32060700);贵州省科技厅农业攻关项目(黔科合支撑〔2017〕2558);贵州省科技厅农业攻关项目(黔科合支撑〔2017〕2557);贵州省教育厅重点领域项目(黔教合KY〔2021〕042);黔西南州科技计划(2019-1-69)

Study on genetic diversity,population structure and genetic differentiation of tea germplasm in Guizhou

AN Hongwei(), SONG Qinfei, NIU Suzhen^*()

College of Tea, Guizhou University, Guiyang 550025, China

Received:2021-03-05 Online:2021-07-25 Published:2021-08-06
Contact: NIU Suzhen

摘要/Abstract

摘要：

以144份贵州茶树种质资源为材料,采用68个EST-SSR标记探究其遗传多样性、群体结构及遗传分化。结果表明,144份茶树种质资源按海拔范围及种都可以分为3类,Gro1代表海拔1 500 m以上的大厂茶群体,Gro2代表海拔范围1 000~1 300 m的茶群体,Gro3代表海拔不明显、种不明显的群体。144份茶树种质资源按种、地区、海拔进行遗传多样性分析发现,群体分化系数(Gst)分别为0.079 7、0.067 7、0.047 0,基因流(Nm)分别为5.774 1、6.885 2、10.134 8,表明遗传变异存在于群体内部个体间,不同群体间存在较强的基因交流。海拔差距越大,遗传距离越远,说明了海拔对于贵州野生茶树种质资源的分类有重要的影响,为更进一步探明贵州茶树种质资源的演化和分布规律奠定基础。

关键词: 茶树种质资源, 群体结构, 遗传多样性

Abstract:

In this study,68 EST-SSR primers were used to analyze the genetic diversity, population structure and genetic differentiation of 144 tea germplasm resources, which were divided into three groups by different altitude ranges and species: Gro1 represented the tea population of Camellia tachangensis(F.C.Zhang) and over 1 500 m altitude, Gro2 represented the tea population of Camellia sinensis(L.) O. Ktze and altitude from 1 000 to 1 300 m, and Gro3 represented a population whose altitude and species are not obvious. The tea germplasmresources were analyzed according to species, zones and altitude ranges, Gst was 0.079 7, 0.067 7, 0.047 0, Nm was 5.774 1, 6.885 2, 10.134 8, respectively, which showed that genetic variation existed among different individuals within populations, and there were strong gene communication among different populations.The greater the altitude gap was,the farther the genetic distance was.This study further explained the altitude effect on the tea germplasm distribution in Guizhou,laid the foundation for further study on the evolution and distribution law of tea germplasm resources in Guizhou.

Key words: tea germplasm, population structure, genetic diversity

中图分类号:

S571.1

安红卫, 宋勤飞, 牛素贞. 贵州茶树种质资源遗传多样性、群体结构和遗传分化研究[J]. 浙江农业学报, 2021, 33(7): 1234-1243.

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图/表 11

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编号 No.	海拔 Altitude/m	种 Species	地点 Zone	推断群体 Inferential group	编号 No.	海拔 Altitude/m	种 Species	地点 Zone	推断群体 Inferential group
1	1742	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	73	1276	茶C.sinensis	普定Puding	群体2 Group 2
2	1742	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	74	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2
3	1734	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	75	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2
4	1742	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	76	1028	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2
5	1744	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	77	1029	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2
6	1737	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	78	1278	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2
7	1897	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	79	1367	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2
8	1446	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体1 Group 1	80	1867	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3
9	1744	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	81	613	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
10	1735	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	82	613	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
11	1733	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	83	614	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
12	1745	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	84	624	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
13	1738	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	85	624	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
14	1892	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	86	628	茶C.sinensis	德江Dejiang	群体2 Group 2
15	1900	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	87	626	茶C.sinensis	德江Dejiang	群体2 Group 2
16	1897	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	88	1373	大厂茶C.tachangensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3
17	1742	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	89	1712	大厂茶C.tachangensis	兴仁Xingren	群体3 Group 3
18	1744	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体2 Group 2	90	1849	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
19	1732	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	91	1855	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
20	1373	大厂茶C.tachangensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	92	1855	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
21	1373	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体2 Group 2	93	1856	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
22	1364	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	94	1023	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体3 Group 3
23	1370	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	95	1446	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体3 Group 3
24	1370	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	96	1446	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体3 Group 3
25	1370	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	97	1307	茶C.sinensis	安顺Anshun	群体3 Group 3
26	621	茶C.sinensis	德江Dejiang	群体2 Group 2	98	1305	茶C.sinensis	安顺Anshun	群体2 Group 2
27	1023	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	99	1303	茶C.sinensis	安顺Anshun	群体2 Group 2
28	1023	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	100	1301	茶C.sinensis	安顺Anshun	群体2 Group 2
29	1072	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	101	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3
30	1072	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	102	1109	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
31	1072	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	103	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
32	1154	茶C.sinensis	贵阳Guiyang	群体3 Group 3	104	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
编号 No.	海拔 Altitude/m	种 Species	地点 Zone	推断群体 Inferential group	编号 No.	海拔 Altitude/m	种 Species	地点 Zone	推断群体 Inferential group
33	1302	大理茶C.taliensis	贵阳Guiyang	群体2 Group 2	105	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3
34	1016	大理茶C.taliensis	金沙Jinsha	群体1 Group 1	106	876	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3
35	1016	大理茶C.taliensis	金沙Jinsha	群体1 Group 1	107	877	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
36	974	大厂茶C.tachangensis	金沙Jinsha	群体3 Group 3	108	878	秃房茶C. gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
37	1290	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	109	1239	秃房茶C.gymnogyna	道真Daozhen	群体3 Group 3
38	1279	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	110	1755	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
39	1346	大厂茶C.tachangensis	贞丰Zhenfen	群体3 Group 3	111	1224	茶C.sinensis	道真Daozhen	群体2 Group 2
40	1478	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	112	829	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2
41	1367	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	113	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体3 Group 3
42	1150	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体3 Group 3	114	1028	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体3 Group 3
43	1302	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	115	772	茶C.sinensis	三都Sandu	群体2 Group 2
44	1446	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体1 Group 1	116	878	茶C.sinensis	正安Zhengan	群体2 Group 2
45	1447	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体1 Group 1	117	1015	大理茶C.taliensis	金沙Jinsha	群体3 Group 3
46	1448	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体3 Group 3	118	1308	茶C.sinensis	贵阳Guiyang	群体2 Group 2
47	1449	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体3 Group 3	119	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
48	1712	大厂茶C.tachangensis	兴仁Xingren	群体1 Group 1	120	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
49	1082	茶C.sinensis	贵定Guiding	群体2 Group 2	121	1616	大理茶C.taliensis	安龙Anlong	群体1 Group 1
50	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2	122	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
51	1082	茶C.sinensis	贵定Guiding	群体2 Group 2	123	1176	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体3 Group 3
52	1456	茶C.sinensis	贵定Guiding	群体2 Group 2	124	1177	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
53	1457	茶C.sinensis	贵定Guiding	群体2 Group 2	125	1178	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
54	1131	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2	126	1155	茶C.sinensis	贵阳Guiyang	群体2 Group 2
55	1132	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2	127	1276	茶C.sinensis	普定Puding	群体2 Group 2
56	829	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2	128	1154	茶C.sinensis	贵阳Guiyang	群体2 Group 2
57	1446	大理茶C.taliensis	贵定Guiding	群体1 Group 1	129	1178	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
58	853	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2	130	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
59	949	茶C.sinensis	正安Zhengan	群体3 Group 3	131	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
60	878	茶C.sinensis	正安Zhengan	群体2 Group 2	132	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
61	1027	茶C.sinensis	荔波Libo	群体3 Group 3	133	1346	茶C.sinensis	普安Puan	群体2 Group 2
62	884	茶C.sinensis	三都Sandu	群体2 Group 2	134	1147	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
63	785	茶C.sinensis	三都Sandu	群体2 Group 2	135	1148	大厂茶C.tachangensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
64	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2	136	1895	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
65	1027	茶C.sinensis	都匀uyun	群体2 Group 2	137	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
66	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2	138	1148	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
67	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2	139	1148	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
68	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3	140	1389	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
69	1131	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3	141	1402	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
70	1132	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体2 Group 2	142	1356	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
71	872	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体2 Group 2	143	1356	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
72	872	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体2 Group 2	144	1356	茶C.sinensis	黎平Liping	群体3 Group 3

编号 No.	海拔 Altitude/m	种 Species	地点 Zone	推断群体 Inferential group	编号 No.	海拔 Altitude/m	种 Species	地点 Zone	推断群体 Inferential group
1	1742	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	73	1276	茶C.sinensis	普定Puding	群体2 Group 2
2	1742	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	74	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2
3	1734	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	75	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2
4	1742	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	76	1028	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2
5	1744	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	77	1029	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2
6	1737	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	78	1278	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2
7	1897	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	79	1367	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2
8	1446	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体1 Group 1	80	1867	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3
9	1744	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	81	613	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
10	1735	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	82	613	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
11	1733	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	83	614	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
12	1745	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	84	624	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
13	1738	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	85	624	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
14	1892	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	86	628	茶C.sinensis	德江Dejiang	群体2 Group 2
15	1900	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	87	626	茶C.sinensis	德江Dejiang	群体2 Group 2
16	1897	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体1 Group 1	88	1373	大厂茶C.tachangensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3
17	1742	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	89	1712	大厂茶C.tachangensis	兴仁Xingren	群体3 Group 3
18	1744	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体2 Group 2	90	1849	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
19	1732	大厂茶C.tachangensis	兴义Xingyi	群体3 Group 3	91	1855	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
20	1373	大厂茶C.tachangensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	92	1855	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
21	1373	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体2 Group 2	93	1856	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
22	1364	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	94	1023	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体3 Group 3
23	1370	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	95	1446	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体3 Group 3
24	1370	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	96	1446	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体3 Group 3
25	1370	大理茶C.taliensis	贞丰Zhenfeng	群体3 Group 3	97	1307	茶C.sinensis	安顺Anshun	群体3 Group 3
26	621	茶C.sinensis	德江Dejiang	群体2 Group 2	98	1305	茶C.sinensis	安顺Anshun	群体2 Group 2
27	1023	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	99	1303	茶C.sinensis	安顺Anshun	群体2 Group 2
28	1023	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	100	1301	茶C.sinensis	安顺Anshun	群体2 Group 2
29	1072	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	101	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3
30	1072	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	102	1109	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
31	1072	茶C.sinensis	印江Yinjiang	群体2 Group 2	103	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
32	1154	茶C.sinensis	贵阳Guiyang	群体3 Group 3	104	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
编号 No.	海拔 Altitude/m	种 Species	地点 Zone	推断群体 Inferential group	编号 No.	海拔 Altitude/m	种 Species	地点 Zone	推断群体 Inferential group
33	1302	大理茶C.taliensis	贵阳Guiyang	群体2 Group 2	105	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3
34	1016	大理茶C.taliensis	金沙Jinsha	群体1 Group 1	106	876	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3
35	1016	大理茶C.taliensis	金沙Jinsha	群体1 Group 1	107	877	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
36	974	大厂茶C.tachangensis	金沙Jinsha	群体3 Group 3	108	878	秃房茶C. gymnogyna	务川Wuchuan	群体1 Group 1
37	1290	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	109	1239	秃房茶C.gymnogyna	道真Daozhen	群体3 Group 3
38	1279	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	110	1755	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
39	1346	大厂茶C.tachangensis	贞丰Zhenfen	群体3 Group 3	111	1224	茶C.sinensis	道真Daozhen	群体2 Group 2
40	1478	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	112	829	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2
41	1367	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	113	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体3 Group 3
42	1150	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体3 Group 3	114	1028	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体3 Group 3
43	1302	茶C.sinensis	雷山Leishan	群体2 Group 2	115	772	茶C.sinensis	三都Sandu	群体2 Group 2
44	1446	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体1 Group 1	116	878	茶C.sinensis	正安Zhengan	群体2 Group 2
45	1447	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体1 Group 1	117	1015	大理茶C.taliensis	金沙Jinsha	群体3 Group 3
46	1448	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体3 Group 3	118	1308	茶C.sinensis	贵阳Guiyang	群体2 Group 2
47	1449	大厂茶C.tachangensis	贵定Guiding	群体3 Group 3	119	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
48	1712	大厂茶C.tachangensis	兴仁Xingren	群体1 Group 1	120	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
49	1082	茶C.sinensis	贵定Guiding	群体2 Group 2	121	1616	大理茶C.taliensis	安龙Anlong	群体1 Group 1
50	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2	122	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
51	1082	茶C.sinensis	贵定Guiding	群体2 Group 2	123	1176	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体3 Group 3
52	1456	茶C.sinensis	贵定Guiding	群体2 Group 2	124	1177	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
53	1457	茶C.sinensis	贵定Guiding	群体2 Group 2	125	1178	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
54	1131	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2	126	1155	茶C.sinensis	贵阳Guiyang	群体2 Group 2
55	1132	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2	127	1276	茶C.sinensis	普定Puding	群体2 Group 2
56	829	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2	128	1154	茶C.sinensis	贵阳Guiyang	群体2 Group 2
57	1446	大理茶C.taliensis	贵定Guiding	群体1 Group 1	129	1178	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
58	853	茶C.sinensis	务川Wuchuan	群体2 Group 2	130	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
59	949	茶C.sinensis	正安Zhengan	群体3 Group 3	131	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
60	878	茶C.sinensis	正安Zhengan	群体2 Group 2	132	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
61	1027	茶C.sinensis	荔波Libo	群体3 Group 3	133	1346	茶C.sinensis	普安Puan	群体2 Group 2
62	884	茶C.sinensis	三都Sandu	群体2 Group 2	134	1147	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
63	785	茶C.sinensis	三都Sandu	群体2 Group 2	135	1148	大厂茶C.tachangensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
64	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2	136	1895	大厂茶C.tachangensis	普安Puan	群体1 Group 1
65	1027	茶C.sinensis	都匀uyun	群体2 Group 2	137	1175	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
66	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2	138	1148	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
67	1027	茶C.sinensis	都匀Duyun	群体2 Group 2	139	1148	茶C.sinensis	晴隆Qinglong	群体2 Group 2
68	1108	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3	140	1389	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
69	1131	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体3 Group 3	141	1402	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
70	1132	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体2 Group 2	142	1356	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
71	872	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体2 Group 2	143	1356	茶C.sinensis	黎平Liping	群体2 Group 2
72	872	秃房茶C.gymnogyna	务川Wuchuan	群体2 Group 2	144	1356	茶C.sinensis	黎平Liping	群体3 Group 3

编号 No.	重复位点 Repeat motif	目的片段大小 Size range/bp	PIC	编号 No.	重复位点 Repeat motif	目的片段大小 Size range/bp	PIC
YIN3	(TC)15	178~197	0.576 5	YIN46	(GAGTGT)4	160~200	0.287 0
YIN7	(TC)13	120~130	0.503 5	YIN47	(TTGTG)3	95~125	0.310 9
YIN8	(TG)8(AG)10	145~155	0.591 0	YIN48	(CCT)5	145~180	0.321 9
YIN9	(CTCTT)3	240	0.437 6	YIN49	(CAT)8	230~260	0.310 3
YIN10	(GGAAA)11	160~175	0.343 8	YIN50	(TTTTG)5	220~270	0.317 7
YIN13	(GTGGA)5	260~280	0.435 2	YIN51	(AGAGA)3	195~330	0.235 5
YIN14	(CT)9	246~265	0.309 5	YIN52	(AT)11	180~205	0.259 8
YIN15	(AG)14	135~148	0.313 8	YIN54	(GCACCA)3	250~290	0.380 7
YIN17	(CT)15	258	0.478 6	YIN55	(AAAAT)3	140~175	0.310 0
YIN21	(TGGAGG)5	204	0.314 3	YIN57	(ACC)8	135~155	0.294 5
YIN22	(TCTGAA)4	110~140	0.488 7	YIN58	(TTTGC)3	120~130	0.107 7
YIN23	A27	306	0.168 2	YIN59	(TTTTTA)3	220~250	0.266 0
YIN24	(CA)12	82~160	0.579 8	YIN67	(CTCA)5	100~160	0.245 4
YIN25	(GT)13(CA)23	222	0.487 5	YIN69	(GCTA)5	160~170	0.282 0
YIN26	A11	189	0.139 3	YIN70	(AAGGTAC)3	180~250	0.275 6
YIN28	(TG)13	160~210	0.289 8	YIN71	(TTTTTG)4	160~210	0.285 5
YIN31	(AG)12	95~120	0.304 1	YIN72	(CAG)5	175~195	0.243 0
YIN32	(GA)9	105~120	0.230 2	YIN75	(TGAG)4	240~300	0.285 9
YIN33	(AG)14	115~130	0.375 3	YIN77	(TCTCTG)3	90~145	0.291 8
YIN34	(GGT)6	170~180	0.446 7	YIN78	(ACTCT)3	175~210	0.320 6
YIN35	(TCA)6	250~270	0.331 3	YIN79	(TATTT)3	185~230	0.280 7
YIN36	(CTCAAT)5	195~215	0.406 8	YIN80	(TGA)8	148~170	0.407 1
YIN37	(CT)11	105~120	0.348 7	YIN82	(TTTC)4	120~140	0.235 1
YIN90	(TAAAA)5	250~270	0.280 4	YIN38	(TGAGT)4	200~210	0.525 8
YIN83	(TTTATT)3	120~135	0.574 0	YIN39	(AT)10	245~265	0.647 6
YIN84	(CACCAA)3	280~300	0.248 6	YIN40	(TC)10	230~255	0.560 5
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YIN87	(TGATG)4	160~200	0.384 2	YIN44	(TC)9	250~270	0.301 4
YIN88	(TTTTC)5	100~135	0.280 1	YIN45	(GTG)5	175~215	0.299 4
YIN89	(GTTTTT)3	160~175	0.314 4	YIN100	(ACC)6	130~150	0.343 8
YIN91	(GCG)7	160~205	0.370 0	YIN92	(CAC)5	160~195	0.109 6
YIN94	(AGG)7	120~150	0.239 4	YIN95	(TAC)6	175~200	0.228 0
YIN96	(TTTG)3	145~175	0.222 2	YIN97	(TA)11	160~170	0.405 2
YIN98	(TA)9	100~120	0.230 8	YIN99	(GAT)9	165~200	0.562 1

编号 No.	重复位点 Repeat motif	目的片段大小 Size range/bp	PIC	编号 No.	重复位点 Repeat motif	目的片段大小 Size range/bp	PIC
YIN3	(TC)15	178~197	0.576 5	YIN46	(GAGTGT)4	160~200	0.287 0
YIN7	(TC)13	120~130	0.503 5	YIN47	(TTGTG)3	95~125	0.310 9
YIN8	(TG)8(AG)10	145~155	0.591 0	YIN48	(CCT)5	145~180	0.321 9
YIN9	(CTCTT)3	240	0.437 6	YIN49	(CAT)8	230~260	0.310 3
YIN10	(GGAAA)11	160~175	0.343 8	YIN50	(TTTTG)5	220~270	0.317 7
YIN13	(GTGGA)5	260~280	0.435 2	YIN51	(AGAGA)3	195~330	0.235 5
YIN14	(CT)9	246~265	0.309 5	YIN52	(AT)11	180~205	0.259 8
YIN15	(AG)14	135~148	0.313 8	YIN54	(GCACCA)3	250~290	0.380 7
YIN17	(CT)15	258	0.478 6	YIN55	(AAAAT)3	140~175	0.310 0
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YIN91	(GCG)7	160~205	0.370 0	YIN92	(CAC)5	160~195	0.109 6
YIN94	(AGG)7	120~150	0.239 4	YIN95	(TAC)6	175~200	0.228 0
YIN96	(TTTG)3	145~175	0.222 2	YIN97	(TA)11	160~170	0.405 2
YIN98	(TA)9	100~120	0.230 8	YIN99	(GAT)9	165~200	0.562 1

	居群 Populations	样品数 Sample size	多态性位点百分率 Percentage of polymorphic loci/%	Ne	H	I
种Species	秃房茶 C.gymnogyna	14	71.82	1.291 5	0.187 0	0.297 8
	茶 C.sinensis	80	91.99	1.279 1	0.185 5	0.304 7
	大厂茶C.tachangensis	39	87.57	1.275 8	0.184 8	0.304 1
	疑似大理茶C.taliensis(W.W.Smith)	11	68.51	1.275 5	0.177 4	0.283 0
地区Zone	黔中 Qianzhong	11	61.88	1.247 0	0.158 7	0.253 4
	黔北 Qianbei	36	87.85	1.294 1	0.193 3	0.314 8
	黔南 Qiannan	27	85.08	1.282 5	0.186 9	0.305 3
	黔东南 Qiandongnan	18	73.76	1.270 3	0.175 1	0.282 4
	黔西南 Qianxinan	52	89.78	1.278 5	0.188 3	0.310 4
海拔范围	500~1 000 m	23	77.90	1.280 6	0.182 4	0.294 3
Altitude/m	1 000~1 300 m	59	93.09	1.286 2	0.191 4	0.315 2
	1 300~1 500 m	34	87.57	1.285 7	0.191 7	0.314 0
	1 500 m以上	28	78.18	1.263 3	0.173 8	0.283 6

贵州茶树种质资源遗传多样性、群体结构和遗传分化研究

Study on genetic diversity,population structure and genetic differentiation of tea germplasm in Guizhou

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种Species	秃房茶C.gymnogyna	茶C.sinensis	大厂茶C.tachangensis
秃房茶C.gymnogyna
茶C.sinensis	0.027 3
大厂茶C.tachangensis	0.026 4	0.017 8
疑似大理茶C.taliensis(W.W.Smith)	0.038 9	0.025 1	0.022 6

地区Zone	黔中Qianzhong	黔北Qianbei	黔南Qiannan	黔东南Qiandongnan
黔中Qianzhong
黔北Qianbei	0.026 5
黔南Qiannan	0.032 2	0.007 8
黔东南Qiandongnan	0.031 5	0.015 2	0.014 2
黔西南Qianxinan	0.032 4	0.010 7	0.011 3	0.019 0

海拔范围 Altitude/m	500~ 1 000 m	1 000~ 1 300 m	1 300~ 1 500 m
500~1 000 m
1 000~1 300 m	0.008 3
1 300~1 500 m	0.012 6	0.006 6
1 500 m以上	0.025 6	0.020 4	0.016 4
More than 1 500 m

项目	样本 Sample	Ht	Hs	Gst	Nm
种Species	144	0.199 6	0.183 7	0.079 7	5.774 1
地区Zone	144	0.193 6	0.180 5	0.067 7	6.885 2
海拔Altitude	144	0.193 9	0.184 8	0.047 0	10.134 8

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