›› 2013, Vol. 25 ›› Issue (1): 0-20.
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棉花水通道蛋白序列生物信息学初步分析
王为1，2，王长彪3， 陈浩东1,4，刘方1，王春英1，张香娣1，王玉红1，王坤波1，*
- 1中国农业科学院 棉花研究所， 棉花生物学国家重点实验室，河南 安阳 455000；2 江苏沿海地区农业科学研究所， 农业部沿海盐碱地科学观测实验站，江苏 盐城 223802；3山西省农业科学院 棉花研究所， 山西 运城 043800; 4湖南省棉花科学研究所 国家杂交棉研究推广中心，湖南 常德 415101
Preliminary bioinformatics analysis of aquaporin sequences available in cotton
WANG Wei;WANG Changbiao;CHEN Haodong;LIU Fang;WANG Chunying;ZHANG Xiangdi;WANG Yyuhong;WANG Kunbo;*
- 1 Cotton Research Institute， Chinese Academy of Agricultural Sciences， State Key Laboratoy of Cotton Biology， China， Anyang 455000， China; 2 Agricultural Science Institute of Coastal Region of Jiangsu， Observation and Experimental Station of Saline Land of Coastal Area， Ministry of Agriculture， Yancheng 224002， China;3 Cotton Research Institute， Shanxi Academy of Agricultural Sciences， Yuncheng 044000, China; 4 Cotton Sciences Research Institute of Hunan, National Hybrid Cotton Research Promotion Center, Changde 415101, China
摘要： 水通道蛋白（aquaporin，AQP）是高效转运水分子的膜内在蛋白，在调控植物的水分关系中有重要作用，和抗旱性能紧密相关。为初步评价分析棉花AQP序列资源，对网上最新且仅有的52条棉花AQP序列进行分子聚类，同时将其进行多序列比对及亚细胞定位，结果表明：棉花AQP大致分为7类，具有丰富的多样性，AQP基因在跨膜转运以及光合中起重要作用。另外，来自水稻、大豆、玉米、拟南芥的328 条AQP序列和52条棉花AQP序进行分子聚类，结果表明：有48条棉花AQP和大豆聚为一类，遗传距离较接近。
