草麻黄高通量转录组分析及黄酮类代谢途径相关基因的鉴定
- （1.中国林业科学研究院 林业研究所/国家林业局林木培育重点实验室，北京 100091； 2.南京林业大学 生物与环境学院， 江苏 南京 210037； 3.南宁树木园，广西 南宁 530031）
Characterization of transcriptome reveals pathway of flavonoids in Ephedra sinica Stapf
- （1. Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation， State Forestry Administration / Research Institute of Forestry， Chinese Academy of Forestry， Beijing 100091， China; 2. College of Biology and the Enviroment， Nanjing Forestry University, Nanjing 210037， China; 3. Nanning Tree Garden， Nanning 530031, China）
摘要： 草麻黄（Ephedra sinica Stapf）植物富含黄酮类和生物碱类化合物，具有重要药用价值，并且适应性强，在防风固沙、改善沙漠环境等方面具有重要作用。通过对已测序草麻黄转录组的原始数据进行重新组装、拼接等生物信息学分析，共得到7 947 954个clean reads，13 389条unigene序列。经过Nr，KOGs，GO，KEGG和SwissProt等数据库分析后，获得10 481个Nr注释，4 533个KOG功能注释，7 121个GO功能注释，5 833个KEGG注释，8 039个 SwissProt注释，并利用KEGG通路分析技术发掘草麻黄中参与黄酮类化合物代谢途径相关基因，为克隆草麻黄黄酮合成关键基因、黄酮类化合物的生物合成提供重要的遗传资源，同时为其抗逆机制的研究和药用价值开发提供依据。
