浙江省水稻立枯丝核菌58S rDNAITS区间多样性

›› 2014, Vol. 26 ›› Issue (3): 0-702707.

• 植物保护 •

浙江省水稻立枯丝核菌58S rDNAITS区间多样性

邱海萍1，2，毛雪琴2，姜华2，王艳丽2，孙国昌2，*

1浙江大学农业与生物技术学院，浙江杭州 310058；2浙江省植物有害生物防控重点实验室——省部共建国家重实验室培育基地，浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所，浙江杭州310021

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2014-05-25 发布日期:2014-05-25

Diversity research on Rhizoctonia solani isolated from Zhejiang Province using sequence analysis of 58S rDNAITS interval

QIU Haiping;MAO Xueqin;JIANG Hua;WANG Yanli;SUN Guochang;*

1College of Agriculture and Biotechnology， Zhejiang University， Hangzhou 310058，China; 2Stata Key Laboratony Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control, Institute of Plant Protection and Microbiology， Zhejiang Academy of Agricultural Sciences， Hangzhou 310021， China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2014-05-25 Published:2014-05-25

摘要/Abstract

摘要： 对浙江省82个水稻立枯丝核菌菌株及13个标准融合群菌株58S rDNAITS(ITS)区间测序和分析，结果表明，ITS在标准融合群菌株间的差异远大于AG1IA融合群的水稻菌株间的差异，进化分析表明， ITS的差异可以有效甄别不同标准融合群菌株，但对AG1IA融合群的水稻菌株区分能力非常有限。单倍型分析表明，这82个水稻菌株可以分为10个单倍型。田间菌株的单倍型多样性(Hd)为0208 7，核苷酸多样性为0000 33。其中单倍型H1为优势单倍型，占全部菌株的878%，而其他9个单倍型则各只有1株菌株。中性检验结果表明Tajimas D测验值为－2260 12(P< 001)，Fu和Lis D测验值为－5208 27(P< 002)，暗示浙江省水稻纹枯菌菌株显著偏离中性假说，在历史上可能出现过种群扩张，并存在很强的选择作用。

关键词: 立枯丝核菌, 水稻, 转录间隔区, 序列测定, 单倍型

Abstract: Eightytwo R. solani strains and 13 standard anastomosis group strains were used in the sequence analysis of 58S rDNAITS (ITS) interval. The differences in sequences of ITS interval among anastomosis group strains were much larger than that among the AG1IA strains. Phylogenetic analysis showed that the differences in sequences of ITS interval could effectively distinguish strains from different anastomosis groups. But when the strains belonging to the same anastomosis group were concerned， the usage of the differences in sequences of ITS interval was quite limited. Haplotype analysis showed that 82 rice strains could be divided into 10 haplotypes．
Haplotype diversity (Hd) of these field isolates was 02087， and the total nucleotide diversity was 000033. H1 was the dominant haplotype， accounting for 878% of all strains， while each of the other nine haplotypes only contained one strain. Neutral test results showed that Tajimas D test value was　-226012 (P<001) and Fu and Lis D test value was -520827 (P<002)， implying that rice sheath blight strains might significantly deviate from neutral equilibrium hypothesis that the R. solani population may be under expansion in the history under strong selection pressure．

Key words: Rhizoctonia solani, rice, internal transcribed spacer, sequence analysis, haplotype

邱海萍;毛雪琴;姜华;王艳丽;孙国昌;*. 浙江省水稻立枯丝核菌58S rDNAITS区间多样性[J]. , 2014, 26(3): 0-702707.

QIU Haiping;MAO Xueqin;JIANG Hua;WANG Yanli;SUN Guochang;*. Diversity research on Rhizoctonia solani isolated from Zhejiang Province using sequence analysis of 58S rDNAITS interval[J]. , 2014, 26(3): 0-702707.

[1]	陈丹, 汤翠凤, 董超, 甘树仙, 李俊, 阿新祥, 张斐斐, 杨雅云, 牛赛赛, 戴陆园. 云南软米地方品种籽粒淀粉品质特性研究[J]. 浙江农业学报, 2021, 33(2): 203-214.
[2]	邹文雄, 吴伟, 关亚静, 曹栋栋, 卞晓波, 施德云, 丁丽玲. 水稻种子休眠调控技术研究进展[J]. 浙江农业学报, 2021, 33(2): 369-379.
[3]	谷建诚, 郭彬, 林义成, 傅庆林, 刘琛, 丁能飞, 李华, 李凝玉. 根表铁膜对水稻镉吸收的影响[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(6): 963-970.
[4]	夏文建, 秦文婧, 刘佳, 陈晓芬, 张丽芳, 曹卫东, 徐昌旭, 陈静蕊. 长期绿肥利用下红壤性水稻土有机碳和可溶性有机碳的垂直分布特征[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(5): 878-885.
[5]	邵文奇, 钟平, 董玉兵, 孙春梅, 纪力, 庄春, 陈川, 章安康. 托盘育苗中光温资源差异及其对水稻秧苗素质的影响[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(2): 191-199.
[6]	杨红云, 罗建军, 孙爱珍, 万颖, 易文龙. 基于图像特征的水稻叶片全氮含量估测模型研究[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(12): 2232-2243.
[7]	张馨月, 李友发, 刘江宁, 富昊伟. 利用广亲和基因S5-n的功能标记鉴定特殊配组类型杂交种纯度研究[J]. 浙江农业学报, 2020, 32(1): 15-19.
[8]	邴静静, 高红梅. 基于SWOT分析的天津市优质稻米产业发展研究--以"小站稻"为例[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(8): 1217-1223.
[9]	潘俊峰, 钟旭华, 黄农荣, 刘彦卓, 田卡, 梁开明, 彭碧琳, 傅友强, 胡香玉. 不同栽培模式对华南双季晚稻产量和氮肥利用率的影响[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(6): 857-868.
[10]	何海燕, 柴荣耀, 邱海萍, 毛雪琴, 王艳丽, 孙国仓. 五个抗稻瘟病基因在浙江省水稻品种中的分布和抗性评价[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(6): 922-929.
[11]	索晨, 罗小三, 赵朕, 孙雪, 张丹, 陈燕. 大气降尘污染对典型农作物生长发育及重金属含量的影响[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(6): 938-945.
[12]	张建桃, 曾家骏, 尹选春, 兰玉彬, 文晟, 林耿纯. 液滴体积对水稻叶面接触角的影响[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(6): 986-995.
[13]	路艳, 杨红云, 周琼, 孙玉婷, 殷华. 基于B样条曲线的水稻叶片几何参数测量系统[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(6): 996-1004.
[14]	苏瑶, 贾生强, 何振超, 杨艳华, 喻曼, 陈喜靖, 沈阿林. 利用响应曲面法优化秸秆腐熟剂的腐解条件[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(5): 798-805.
[15]	王保君, 程旺大, 陈贵, 沈亚强, 张红梅. 秸秆还田配合氮肥减量对稻田土壤养分、碳库及水稻产量的影响[J]. 浙江农业学报, 2019, 31(4): 624-630.

浙江省水稻立枯丝核菌58S rDNAITS区间多样性

Diversity research on Rhizoctonia solani isolated from Zhejiang Province using sequence analysis of 58S rDNAITS interval

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价